Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE55

Pdgfrl, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrlQ6PE55 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
PdgfrlQ6PE55 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PdgfrlQ6PE55 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PdgfrlQ6PE55 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PdgfrlQ6PE55 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PdgfrlQ6PE55 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PdgfrlQ6PE55 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PdgfrlQ6PE55 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PdgfrlQ6PE55 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PdgfrlQ6PE55 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PdgfrlQ6PE55 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PdgfrlQ6PE55 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PdgfrlQ6PE55 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PdgfrlQ6PE55 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PdgfrlQ6PE55 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PdgfrlQ6PE55 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PdgfrlQ6PE55 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PdgfrlQ6PE55 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PdgfrlQ6PE55 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PdgfrlQ6PE55 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PdgfrlQ6PE55 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PdgfrlQ6PE55 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PdgfrlQ6PE55 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PdgfrlQ6PE55 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PdgfrlQ6PE55 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PdgfrlQ6PE55 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PdgfrlQ6PE55 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PdgfrlQ6PE55 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PdgfrlQ6PE55 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PdgfrlQ6PE55 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PdgfrlQ6PE55 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PdgfrlQ6PE55 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PdgfrlQ6PE55 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PdgfrlQ6PE55 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PdgfrlQ6PE55 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PdgfrlQ6PE55 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PdgfrlQ6PE55 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PdgfrlQ6PE55 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PdgfrlQ6PE55 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PdgfrlQ6PE55 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PdgfrlQ6PE55 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PdgfrlQ6PE55 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PdgfrlQ6PE55 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PdgfrlQ6PE55 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PdgfrlQ6PE55 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PdgfrlQ6PE55 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PdgfrlQ6PE55 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PdgfrlQ6PE55 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PdgfrlQ6PE55 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PdgfrlQ6PE55 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PdgfrlQ6PE55 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PdgfrlQ6PE55 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PdgfrlQ6PE55 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PdgfrlQ6PE55 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PdgfrlQ6PE55 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PdgfrlQ6PE55 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PdgfrlQ6PE55 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PdgfrlQ6PE55 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PdgfrlQ6PE55 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PdgfrlQ6PE55 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PdgfrlQ6PE55 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PdgfrlQ6PE55 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PdgfrlQ6PE55 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PdgfrlQ6PE55 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PdgfrlQ6PE55 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PdgfrlQ6PE55 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PdgfrlQ6PE55 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PdgfrlQ6PE55 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PdgfrlQ6PE55 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PdgfrlQ6PE55 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PdgfrlQ6PE55 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PdgfrlQ6PE55 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PdgfrlQ6PE55 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PdgfrlQ6PE55 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PdgfrlQ6PE55 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PdgfrlQ6PE55 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PdgfrlQ6PE55 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PdgfrlQ6PE55 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PdgfrlQ6PE55 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PdgfrlQ6PE55 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PdgfrlQ6PE55 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PdgfrlQ6PE55 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PdgfrlQ6PE55 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PdgfrlQ6PE55 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PdgfrlQ6PE55 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PdgfrlQ6PE55 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PdgfrlQ6PE55 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PdgfrlQ6PE55 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PdgfrlQ6PE55 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PdgfrlQ6PE55 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PdgfrlQ6PE55 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PdgfrlQ6PE55 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PdgfrlQ6PE55 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PdgfrlQ6PE55 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PdgfrlQ6PE55 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PdgfrlQ6PE55 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PdgfrlQ6PE55 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PdgfrlQ6PE55 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PdgfrlQ6PE55 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PdgfrlQ6PE55 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.4 ms