Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE01

Snrnp40, U5 small nuclear ribonucleoprotein 40 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp40Q6PE01 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrnp40Q6PE01 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrnp40Q6PE01 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrnp40Q6PE01 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrnp40Q6PE01 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrnp40Q6PE01 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrnp40Q6PE01 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrnp40Q6PE01 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrnp40Q6PE01 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrnp40Q6PE01 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrnp40Q6PE01 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrnp40Q6PE01 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrnp40Q6PE01 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrnp40Q6PE01 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrnp40Q6PE01 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrnp40Q6PE01 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrnp40Q6PE01 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrnp40Q6PE01 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrnp40Q6PE01 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrnp40Q6PE01 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrnp40Q6PE01 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrnp40Q6PE01 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrnp40Q6PE01 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrnp40Q6PE01 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrnp40Q6PE01 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrnp40Q6PE01 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrnp40Q6PE01 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrnp40Q6PE01 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrnp40Q6PE01 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrnp40Q6PE01 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrnp40Q6PE01 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrnp40Q6PE01 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrnp40Q6PE01 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrnp40Q6PE01 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrnp40Q6PE01 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrnp40Q6PE01 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrnp40Q6PE01 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrnp40Q6PE01 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrnp40Q6PE01 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrnp40Q6PE01 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrnp40Q6PE01 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrnp40Q6PE01 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrnp40Q6PE01 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrnp40Q6PE01 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrnp40Q6PE01 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrnp40Q6PE01 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrnp40Q6PE01 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrnp40Q6PE01 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrnp40Q6PE01 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrnp40Q6PE01 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrnp40Q6PE01 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrnp40Q6PE01 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrnp40Q6PE01 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrnp40Q6PE01 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrnp40Q6PE01 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrnp40Q6PE01 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrnp40Q6PE01 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrnp40Q6PE01 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrnp40Q6PE01 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrnp40Q6PE01 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrnp40Q6PE01 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrnp40Q6PE01 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrnp40Q6PE01 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrnp40Q6PE01 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrnp40Q6PE01 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrnp40Q6PE01 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrnp40Q6PE01 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrnp40Q6PE01 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrnp40Q6PE01 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrnp40Q6PE01 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrnp40Q6PE01 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrnp40Q6PE01 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrnp40Q6PE01 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrnp40Q6PE01 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrnp40Q6PE01 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrnp40Q6PE01 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrnp40Q6PE01 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrnp40Q6PE01 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrnp40Q6PE01 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrnp40Q6PE01 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrnp40Q6PE01 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrnp40Q6PE01 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrnp40Q6PE01 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrnp40Q6PE01 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrnp40Q6PE01 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrnp40Q6PE01 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrnp40Q6PE01 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrnp40Q6PE01 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrnp40Q6PE01 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrnp40Q6PE01 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrnp40Q6PE01 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrnp40Q6PE01 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrnp40Q6PE01 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrnp40Q6PE01 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrnp40Q6PE01 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrnp40Q6PE01 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrnp40Q6PE01 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrnp40Q6PE01 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrnp40Q6PE01 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrnp40Q6PE01 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms