Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS0

Vstm2l, V-set and transmembrane domain-containing protein 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2lQ6PDS0 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vstm2lQ6PDS0 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vstm2lQ6PDS0 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vstm2lQ6PDS0 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vstm2lQ6PDS0 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vstm2lQ6PDS0 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vstm2lQ6PDS0 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Vstm2lQ6PDS0 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vstm2lQ6PDS0 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vstm2lQ6PDS0 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vstm2lQ6PDS0 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vstm2lQ6PDS0 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vstm2lQ6PDS0 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vstm2lQ6PDS0 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vstm2lQ6PDS0 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vstm2lQ6PDS0 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vstm2lQ6PDS0 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vstm2lQ6PDS0 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vstm2lQ6PDS0 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vstm2lQ6PDS0 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vstm2lQ6PDS0 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vstm2lQ6PDS0 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Vstm2lQ6PDS0 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vstm2lQ6PDS0 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vstm2lQ6PDS0 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vstm2lQ6PDS0 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vstm2lQ6PDS0 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vstm2lQ6PDS0 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vstm2lQ6PDS0 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vstm2lQ6PDS0 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vstm2lQ6PDS0 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vstm2lQ6PDS0 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vstm2lQ6PDS0 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vstm2lQ6PDS0 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vstm2lQ6PDS0 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vstm2lQ6PDS0 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Vstm2lQ6PDS0 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Vstm2lQ6PDS0 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vstm2lQ6PDS0 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vstm2lQ6PDS0 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vstm2lQ6PDS0 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vstm2lQ6PDS0 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vstm2lQ6PDS0 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vstm2lQ6PDS0 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vstm2lQ6PDS0 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vstm2lQ6PDS0 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vstm2lQ6PDS0 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vstm2lQ6PDS0 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vstm2lQ6PDS0 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vstm2lQ6PDS0 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Vstm2lQ6PDS0 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vstm2lQ6PDS0 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vstm2lQ6PDS0 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vstm2lQ6PDS0 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vstm2lQ6PDS0 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vstm2lQ6PDS0 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vstm2lQ6PDS0 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vstm2lQ6PDS0 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vstm2lQ6PDS0 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vstm2lQ6PDS0 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vstm2lQ6PDS0 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vstm2lQ6PDS0 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vstm2lQ6PDS0 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vstm2lQ6PDS0 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vstm2lQ6PDS0 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vstm2lQ6PDS0 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vstm2lQ6PDS0 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vstm2lQ6PDS0 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vstm2lQ6PDS0 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vstm2lQ6PDS0 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vstm2lQ6PDS0 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vstm2lQ6PDS0 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vstm2lQ6PDS0 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vstm2lQ6PDS0 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vstm2lQ6PDS0 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vstm2lQ6PDS0 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vstm2lQ6PDS0 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vstm2lQ6PDS0 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vstm2lQ6PDS0 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vstm2lQ6PDS0 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vstm2lQ6PDS0 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vstm2lQ6PDS0 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vstm2lQ6PDS0 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vstm2lQ6PDS0 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vstm2lQ6PDS0 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Vstm2lQ6PDS0 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vstm2lQ6PDS0 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vstm2lQ6PDS0 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vstm2lQ6PDS0 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vstm2lQ6PDS0 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vstm2lQ6PDS0 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vstm2lQ6PDS0 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vstm2lQ6PDS0 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vstm2lQ6PDS0 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vstm2lQ6PDS0 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vstm2lQ6PDS0 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vstm2lQ6PDS0 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vstm2lQ6PDS0 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vstm2lQ6PDS0 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vstm2lQ6PDS0 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms