Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SvoplQ6PDF3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SvoplQ6PDF3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SvoplQ6PDF3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SvoplQ6PDF3 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SvoplQ6PDF3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SvoplQ6PDF3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SvoplQ6PDF3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SvoplQ6PDF3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SvoplQ6PDF3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SvoplQ6PDF3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SvoplQ6PDF3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SvoplQ6PDF3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SvoplQ6PDF3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SvoplQ6PDF3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SvoplQ6PDF3 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SvoplQ6PDF3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SvoplQ6PDF3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SvoplQ6PDF3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SvoplQ6PDF3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SvoplQ6PDF3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SvoplQ6PDF3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SvoplQ6PDF3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SvoplQ6PDF3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SvoplQ6PDF3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SvoplQ6PDF3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SvoplQ6PDF3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SvoplQ6PDF3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SvoplQ6PDF3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SvoplQ6PDF3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SvoplQ6PDF3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SvoplQ6PDF3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SvoplQ6PDF3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SvoplQ6PDF3 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SvoplQ6PDF3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SvoplQ6PDF3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SvoplQ6PDF3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SvoplQ6PDF3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SvoplQ6PDF3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SvoplQ6PDF3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SvoplQ6PDF3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SvoplQ6PDF3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SvoplQ6PDF3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SvoplQ6PDF3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SvoplQ6PDF3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SvoplQ6PDF3 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SvoplQ6PDF3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SvoplQ6PDF3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SvoplQ6PDF3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SvoplQ6PDF3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SvoplQ6PDF3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SvoplQ6PDF3 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SvoplQ6PDF3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SvoplQ6PDF3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SvoplQ6PDF3 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SvoplQ6PDF3 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SvoplQ6PDF3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SvoplQ6PDF3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SvoplQ6PDF3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SvoplQ6PDF3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SvoplQ6PDF3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SvoplQ6PDF3 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SvoplQ6PDF3 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SvoplQ6PDF3 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SvoplQ6PDF3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SvoplQ6PDF3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SvoplQ6PDF3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SvoplQ6PDF3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SvoplQ6PDF3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SvoplQ6PDF3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SvoplQ6PDF3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SvoplQ6PDF3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SvoplQ6PDF3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SvoplQ6PDF3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SvoplQ6PDF3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SvoplQ6PDF3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SvoplQ6PDF3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SvoplQ6PDF3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SvoplQ6PDF3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SvoplQ6PDF3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SvoplQ6PDF3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SvoplQ6PDF3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SvoplQ6PDF3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SvoplQ6PDF3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SvoplQ6PDF3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SvoplQ6PDF3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SvoplQ6PDF3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SvoplQ6PDF3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SvoplQ6PDF3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SvoplQ6PDF3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SvoplQ6PDF3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SvoplQ6PDF3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SvoplQ6PDF3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SvoplQ6PDF3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SvoplQ6PDF3 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SvoplQ6PDF3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SvoplQ6PDF3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SvoplQ6PDF3 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SvoplQ6PDF3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SvoplQ6PDF3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms