Protein–RNA interactions for Protein: Q6PA06

Atl2, Atlastin-2, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl2Q6PA06 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atl2Q6PA06 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atl2Q6PA06 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atl2Q6PA06 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atl2Q6PA06 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atl2Q6PA06 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atl2Q6PA06 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Atl2Q6PA06 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Atl2Q6PA06 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atl2Q6PA06 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Atl2Q6PA06 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atl2Q6PA06 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atl2Q6PA06 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atl2Q6PA06 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atl2Q6PA06 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Atl2Q6PA06 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atl2Q6PA06 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atl2Q6PA06 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atl2Q6PA06 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atl2Q6PA06 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atl2Q6PA06 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atl2Q6PA06 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atl2Q6PA06 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atl2Q6PA06 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atl2Q6PA06 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atl2Q6PA06 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atl2Q6PA06 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Atl2Q6PA06 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atl2Q6PA06 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atl2Q6PA06 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atl2Q6PA06 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atl2Q6PA06 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atl2Q6PA06 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atl2Q6PA06 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atl2Q6PA06 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atl2Q6PA06 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atl2Q6PA06 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atl2Q6PA06 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atl2Q6PA06 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atl2Q6PA06 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atl2Q6PA06 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atl2Q6PA06 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atl2Q6PA06 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Atl2Q6PA06 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atl2Q6PA06 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atl2Q6PA06 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atl2Q6PA06 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atl2Q6PA06 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atl2Q6PA06 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atl2Q6PA06 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atl2Q6PA06 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atl2Q6PA06 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atl2Q6PA06 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atl2Q6PA06 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atl2Q6PA06 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Atl2Q6PA06 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atl2Q6PA06 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atl2Q6PA06 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atl2Q6PA06 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atl2Q6PA06 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atl2Q6PA06 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atl2Q6PA06 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atl2Q6PA06 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atl2Q6PA06 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atl2Q6PA06 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atl2Q6PA06 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atl2Q6PA06 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atl2Q6PA06 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atl2Q6PA06 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Atl2Q6PA06 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atl2Q6PA06 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atl2Q6PA06 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atl2Q6PA06 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atl2Q6PA06 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atl2Q6PA06 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atl2Q6PA06 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atl2Q6PA06 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atl2Q6PA06 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atl2Q6PA06 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atl2Q6PA06 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atl2Q6PA06 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atl2Q6PA06 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atl2Q6PA06 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atl2Q6PA06 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atl2Q6PA06 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atl2Q6PA06 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atl2Q6PA06 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atl2Q6PA06 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atl2Q6PA06 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Atl2Q6PA06 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atl2Q6PA06 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atl2Q6PA06 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atl2Q6PA06 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atl2Q6PA06 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atl2Q6PA06 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atl2Q6PA06 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atl2Q6PA06 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atl2Q6PA06 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atl2Q6PA06 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atl2Q6PA06 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms