Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9Z1

Smarcd3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcd3Q6P9Z1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Smarcd3Q6P9Z1 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smarcd3Q6P9Z1 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smarcd3Q6P9Z1 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smarcd3Q6P9Z1 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smarcd3Q6P9Z1 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smarcd3Q6P9Z1 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smarcd3Q6P9Z1 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smarcd3Q6P9Z1 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smarcd3Q6P9Z1 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smarcd3Q6P9Z1 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smarcd3Q6P9Z1 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smarcd3Q6P9Z1 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smarcd3Q6P9Z1 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smarcd3Q6P9Z1 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smarcd3Q6P9Z1 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smarcd3Q6P9Z1 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smarcd3Q6P9Z1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smarcd3Q6P9Z1 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smarcd3Q6P9Z1 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smarcd3Q6P9Z1 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smarcd3Q6P9Z1 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smarcd3Q6P9Z1 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smarcd3Q6P9Z1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smarcd3Q6P9Z1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smarcd3Q6P9Z1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smarcd3Q6P9Z1 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smarcd3Q6P9Z1 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smarcd3Q6P9Z1 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Smarcd3Q6P9Z1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smarcd3Q6P9Z1 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smarcd3Q6P9Z1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smarcd3Q6P9Z1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smarcd3Q6P9Z1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smarcd3Q6P9Z1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smarcd3Q6P9Z1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smarcd3Q6P9Z1 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smarcd3Q6P9Z1 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smarcd3Q6P9Z1 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smarcd3Q6P9Z1 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smarcd3Q6P9Z1 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smarcd3Q6P9Z1 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smarcd3Q6P9Z1 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smarcd3Q6P9Z1 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smarcd3Q6P9Z1 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smarcd3Q6P9Z1 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smarcd3Q6P9Z1 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smarcd3Q6P9Z1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smarcd3Q6P9Z1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smarcd3Q6P9Z1 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Smarcd3Q6P9Z1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms