Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5U8

Ccdc148, Coiled-coil domain-containing protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc148Q6P5U8 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc148Q6P5U8 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc148Q6P5U8 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc148Q6P5U8 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc148Q6P5U8 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc148Q6P5U8 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc148Q6P5U8 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc148Q6P5U8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc148Q6P5U8 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc148Q6P5U8 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc148Q6P5U8 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc148Q6P5U8 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc148Q6P5U8 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc148Q6P5U8 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc148Q6P5U8 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc148Q6P5U8 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc148Q6P5U8 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc148Q6P5U8 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc148Q6P5U8 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc148Q6P5U8 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc148Q6P5U8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc148Q6P5U8 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc148Q6P5U8 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc148Q6P5U8 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc148Q6P5U8 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc148Q6P5U8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc148Q6P5U8 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc148Q6P5U8 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc148Q6P5U8 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc148Q6P5U8 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc148Q6P5U8 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc148Q6P5U8 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc148Q6P5U8 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc148Q6P5U8 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc148Q6P5U8 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc148Q6P5U8 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc148Q6P5U8 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc148Q6P5U8 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc148Q6P5U8 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc148Q6P5U8 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc148Q6P5U8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc148Q6P5U8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc148Q6P5U8 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc148Q6P5U8 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc148Q6P5U8 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc148Q6P5U8 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc148Q6P5U8 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc148Q6P5U8 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc148Q6P5U8 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc148Q6P5U8 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc148Q6P5U8 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc148Q6P5U8 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc148Q6P5U8 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc148Q6P5U8 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc148Q6P5U8 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc148Q6P5U8 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc148Q6P5U8 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc148Q6P5U8 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc148Q6P5U8 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc148Q6P5U8 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc148Q6P5U8 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc148Q6P5U8 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc148Q6P5U8 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc148Q6P5U8 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc148Q6P5U8 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc148Q6P5U8 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc148Q6P5U8 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc148Q6P5U8 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc148Q6P5U8 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc148Q6P5U8 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc148Q6P5U8 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc148Q6P5U8 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc148Q6P5U8 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc148Q6P5U8 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc148Q6P5U8 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc148Q6P5U8 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc148Q6P5U8 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc148Q6P5U8 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc148Q6P5U8 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc148Q6P5U8 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc148Q6P5U8 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc148Q6P5U8 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc148Q6P5U8 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc148Q6P5U8 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc148Q6P5U8 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc148Q6P5U8 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc148Q6P5U8 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc148Q6P5U8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc148Q6P5U8 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc148Q6P5U8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc148Q6P5U8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc148Q6P5U8 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc148Q6P5U8 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc148Q6P5U8 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc148Q6P5U8 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc148Q6P5U8 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc148Q6P5U8 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc148Q6P5U8 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc148Q6P5U8 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc148Q6P5U8 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms