Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5U7

Nwd2, NACHT and WD repeat domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nwd2Q6P5U7 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nwd2Q6P5U7 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nwd2Q6P5U7 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nwd2Q6P5U7 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Nwd2Q6P5U7 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nwd2Q6P5U7 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nwd2Q6P5U7 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nwd2Q6P5U7 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nwd2Q6P5U7 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nwd2Q6P5U7 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nwd2Q6P5U7 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nwd2Q6P5U7 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nwd2Q6P5U7 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Nwd2Q6P5U7 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nwd2Q6P5U7 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nwd2Q6P5U7 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nwd2Q6P5U7 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nwd2Q6P5U7 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nwd2Q6P5U7 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nwd2Q6P5U7 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Nwd2Q6P5U7 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nwd2Q6P5U7 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nwd2Q6P5U7 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nwd2Q6P5U7 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nwd2Q6P5U7 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nwd2Q6P5U7 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nwd2Q6P5U7 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nwd2Q6P5U7 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nwd2Q6P5U7 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nwd2Q6P5U7 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Nwd2Q6P5U7 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nwd2Q6P5U7 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nwd2Q6P5U7 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nwd2Q6P5U7 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nwd2Q6P5U7 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nwd2Q6P5U7 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nwd2Q6P5U7 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nwd2Q6P5U7 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nwd2Q6P5U7 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nwd2Q6P5U7 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nwd2Q6P5U7 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nwd2Q6P5U7 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nwd2Q6P5U7 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nwd2Q6P5U7 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nwd2Q6P5U7 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nwd2Q6P5U7 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nwd2Q6P5U7 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nwd2Q6P5U7 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nwd2Q6P5U7 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nwd2Q6P5U7 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nwd2Q6P5U7 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nwd2Q6P5U7 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nwd2Q6P5U7 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nwd2Q6P5U7 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nwd2Q6P5U7 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Nwd2Q6P5U7 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nwd2Q6P5U7 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nwd2Q6P5U7 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nwd2Q6P5U7 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nwd2Q6P5U7 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nwd2Q6P5U7 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nwd2Q6P5U7 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nwd2Q6P5U7 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nwd2Q6P5U7 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nwd2Q6P5U7 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nwd2Q6P5U7 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nwd2Q6P5U7 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nwd2Q6P5U7 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Nwd2Q6P5U7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nwd2Q6P5U7 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nwd2Q6P5U7 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nwd2Q6P5U7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nwd2Q6P5U7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Nwd2Q6P5U7 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Nwd2Q6P5U7 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nwd2Q6P5U7 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nwd2Q6P5U7 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nwd2Q6P5U7 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nwd2Q6P5U7 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nwd2Q6P5U7 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nwd2Q6P5U7 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nwd2Q6P5U7 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nwd2Q6P5U7 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nwd2Q6P5U7 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nwd2Q6P5U7 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nwd2Q6P5U7 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nwd2Q6P5U7 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nwd2Q6P5U7 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Nwd2Q6P5U7 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nwd2Q6P5U7 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nwd2Q6P5U7 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nwd2Q6P5U7 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nwd2Q6P5U7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nwd2Q6P5U7 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nwd2Q6P5U7 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nwd2Q6P5U7 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nwd2Q6P5U7 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nwd2Q6P5U7 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nwd2Q6P5U7 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nwd2Q6P5U7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
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