Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5B0

Rrp12, RRP12-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp12Q6P5B0 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rrp12Q6P5B0 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rrp12Q6P5B0 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rrp12Q6P5B0 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rrp12Q6P5B0 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rrp12Q6P5B0 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rrp12Q6P5B0 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rrp12Q6P5B0 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rrp12Q6P5B0 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rrp12Q6P5B0 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rrp12Q6P5B0 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rrp12Q6P5B0 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rrp12Q6P5B0 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rrp12Q6P5B0 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rrp12Q6P5B0 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rrp12Q6P5B0 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rrp12Q6P5B0 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rrp12Q6P5B0 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rrp12Q6P5B0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rrp12Q6P5B0 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rrp12Q6P5B0 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Rrp12Q6P5B0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rrp12Q6P5B0 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Rrp12Q6P5B0 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Rrp12Q6P5B0 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rrp12Q6P5B0 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rrp12Q6P5B0 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rrp12Q6P5B0 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rrp12Q6P5B0 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rrp12Q6P5B0 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rrp12Q6P5B0 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rrp12Q6P5B0 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rrp12Q6P5B0 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rrp12Q6P5B0 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rrp12Q6P5B0 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rrp12Q6P5B0 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rrp12Q6P5B0 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rrp12Q6P5B0 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rrp12Q6P5B0 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rrp12Q6P5B0 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Rrp12Q6P5B0 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rrp12Q6P5B0 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rrp12Q6P5B0 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rrp12Q6P5B0 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rrp12Q6P5B0 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rrp12Q6P5B0 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rrp12Q6P5B0 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rrp12Q6P5B0 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rrp12Q6P5B0 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rrp12Q6P5B0 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rrp12Q6P5B0 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rrp12Q6P5B0 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rrp12Q6P5B0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rrp12Q6P5B0 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rrp12Q6P5B0 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rrp12Q6P5B0 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rrp12Q6P5B0 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rrp12Q6P5B0 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rrp12Q6P5B0 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Rrp12Q6P5B0 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rrp12Q6P5B0 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rrp12Q6P5B0 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rrp12Q6P5B0 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rrp12Q6P5B0 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rrp12Q6P5B0 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rrp12Q6P5B0 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Rrp12Q6P5B0 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rrp12Q6P5B0 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rrp12Q6P5B0 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rrp12Q6P5B0 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rrp12Q6P5B0 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rrp12Q6P5B0 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rrp12Q6P5B0 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Rrp12Q6P5B0 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rrp12Q6P5B0 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rrp12Q6P5B0 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rrp12Q6P5B0 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rrp12Q6P5B0 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Rrp12Q6P5B0 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rrp12Q6P5B0 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rrp12Q6P5B0 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rrp12Q6P5B0 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rrp12Q6P5B0 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rrp12Q6P5B0 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rrp12Q6P5B0 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rrp12Q6P5B0 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Rrp12Q6P5B0 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Rrp12Q6P5B0 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rrp12Q6P5B0 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Rrp12Q6P5B0 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rrp12Q6P5B0 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rrp12Q6P5B0 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rrp12Q6P5B0 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rrp12Q6P5B0 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rrp12Q6P5B0 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rrp12Q6P5B0 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rrp12Q6P5B0 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rrp12Q6P5B0 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rrp12Q6P5B0 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rrp12Q6P5B0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms