Protein–RNA interactions for Protein: Q6P539

Fam222b, Protein FAM222B, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam222bQ6P539 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam222bQ6P539 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam222bQ6P539 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam222bQ6P539 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam222bQ6P539 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam222bQ6P539 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam222bQ6P539 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam222bQ6P539 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam222bQ6P539 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam222bQ6P539 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam222bQ6P539 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam222bQ6P539 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam222bQ6P539 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam222bQ6P539 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam222bQ6P539 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam222bQ6P539 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam222bQ6P539 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam222bQ6P539 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam222bQ6P539 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam222bQ6P539 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam222bQ6P539 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam222bQ6P539 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam222bQ6P539 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam222bQ6P539 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam222bQ6P539 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam222bQ6P539 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam222bQ6P539 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam222bQ6P539 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam222bQ6P539 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam222bQ6P539 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam222bQ6P539 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam222bQ6P539 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fam222bQ6P539 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fam222bQ6P539 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fam222bQ6P539 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam222bQ6P539 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Fam222bQ6P539 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Fam222bQ6P539 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam222bQ6P539 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam222bQ6P539 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam222bQ6P539 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fam222bQ6P539 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam222bQ6P539 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam222bQ6P539 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam222bQ6P539 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam222bQ6P539 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Fam222bQ6P539 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Fam222bQ6P539 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam222bQ6P539 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Fam222bQ6P539 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam222bQ6P539 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam222bQ6P539 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam222bQ6P539 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam222bQ6P539 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fam222bQ6P539 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fam222bQ6P539 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam222bQ6P539 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam222bQ6P539 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fam222bQ6P539 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam222bQ6P539 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam222bQ6P539 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam222bQ6P539 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fam222bQ6P539 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam222bQ6P539 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam222bQ6P539 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Fam222bQ6P539 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam222bQ6P539 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam222bQ6P539 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fam222bQ6P539 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam222bQ6P539 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fam222bQ6P539 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam222bQ6P539 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fam222bQ6P539 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam222bQ6P539 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Fam222bQ6P539 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam222bQ6P539 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam222bQ6P539 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fam222bQ6P539 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Fam222bQ6P539 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam222bQ6P539 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam222bQ6P539 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam222bQ6P539 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fam222bQ6P539 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Fam222bQ6P539 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam222bQ6P539 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam222bQ6P539 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam222bQ6P539 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fam222bQ6P539 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fam222bQ6P539 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Fam222bQ6P539 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Fam222bQ6P539 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fam222bQ6P539 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam222bQ6P539 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Fam222bQ6P539 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam222bQ6P539 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam222bQ6P539 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Fam222bQ6P539 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Fam222bQ6P539 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam222bQ6P539 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam222bQ6P539 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms