Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Slx4Q6P1D7 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Slx4Q6P1D7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Slx4Q6P1D7 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Slx4Q6P1D7 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Slx4Q6P1D7 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Slx4Q6P1D7 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Slx4Q6P1D7 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Slx4Q6P1D7 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Slx4Q6P1D7 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Slx4Q6P1D7 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Slx4Q6P1D7 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Slx4Q6P1D7 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Slx4Q6P1D7 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Slx4Q6P1D7 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Slx4Q6P1D7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Slx4Q6P1D7 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Slx4Q6P1D7 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Slx4Q6P1D7 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Slx4Q6P1D7 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Slx4Q6P1D7 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Slx4Q6P1D7 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Slx4Q6P1D7 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Slx4Q6P1D7 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Slx4Q6P1D7 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Slx4Q6P1D7 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Slx4Q6P1D7 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Slx4Q6P1D7 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Slx4Q6P1D7 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Slx4Q6P1D7 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Slx4Q6P1D7 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Slx4Q6P1D7 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Slx4Q6P1D7 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Slx4Q6P1D7 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Slx4Q6P1D7 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Slx4Q6P1D7 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Slx4Q6P1D7 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Slx4Q6P1D7 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Slx4Q6P1D7 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Slx4Q6P1D7 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Slx4Q6P1D7 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Slx4Q6P1D7 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Slx4Q6P1D7 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Slx4Q6P1D7 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Slx4Q6P1D7 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Slx4Q6P1D7 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Slx4Q6P1D7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Slx4Q6P1D7 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Slx4Q6P1D7 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Slx4Q6P1D7 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Slx4Q6P1D7 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Slx4Q6P1D7 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Slx4Q6P1D7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Slx4Q6P1D7 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Slx4Q6P1D7 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Slx4Q6P1D7 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Slx4Q6P1D7 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Slx4Q6P1D7 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Slx4Q6P1D7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Slx4Q6P1D7 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Slx4Q6P1D7 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Slx4Q6P1D7 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Slx4Q6P1D7 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Slx4Q6P1D7 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Slx4Q6P1D7 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Slx4Q6P1D7 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Slx4Q6P1D7 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Slx4Q6P1D7 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Slx4Q6P1D7 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Slx4Q6P1D7 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Slx4Q6P1D7 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Slx4Q6P1D7 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Slx4Q6P1D7 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Slx4Q6P1D7 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Slx4Q6P1D7 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Slx4Q6P1D7 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Slx4Q6P1D7 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Slx4Q6P1D7 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Slx4Q6P1D7 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Slx4Q6P1D7 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Slx4Q6P1D7 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Slx4Q6P1D7 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Slx4Q6P1D7 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Slx4Q6P1D7 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Slx4Q6P1D7 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Slx4Q6P1D7 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Slx4Q6P1D7 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Slx4Q6P1D7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Slx4Q6P1D7 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Slx4Q6P1D7 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Slx4Q6P1D7 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Slx4Q6P1D7 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Slx4Q6P1D7 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Slx4Q6P1D7 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Slx4Q6P1D7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Slx4Q6P1D7 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Slx4Q6P1D7 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Slx4Q6P1D7 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Slx4Q6P1D7 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Slx4Q6P1D7 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms