Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZC7

Sec23ip, SEC23-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23ipQ6NZC7 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sec23ipQ6NZC7 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Sec23ipQ6NZC7 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sec23ipQ6NZC7 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sec23ipQ6NZC7 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sec23ipQ6NZC7 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sec23ipQ6NZC7 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sec23ipQ6NZC7 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sec23ipQ6NZC7 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sec23ipQ6NZC7 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sec23ipQ6NZC7 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sec23ipQ6NZC7 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sec23ipQ6NZC7 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sec23ipQ6NZC7 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sec23ipQ6NZC7 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sec23ipQ6NZC7 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Sec23ipQ6NZC7 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sec23ipQ6NZC7 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sec23ipQ6NZC7 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sec23ipQ6NZC7 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sec23ipQ6NZC7 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sec23ipQ6NZC7 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sec23ipQ6NZC7 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sec23ipQ6NZC7 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sec23ipQ6NZC7 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sec23ipQ6NZC7 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sec23ipQ6NZC7 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sec23ipQ6NZC7 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sec23ipQ6NZC7 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sec23ipQ6NZC7 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Sec23ipQ6NZC7 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sec23ipQ6NZC7 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sec23ipQ6NZC7 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sec23ipQ6NZC7 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sec23ipQ6NZC7 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sec23ipQ6NZC7 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sec23ipQ6NZC7 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sec23ipQ6NZC7 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sec23ipQ6NZC7 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sec23ipQ6NZC7 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sec23ipQ6NZC7 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sec23ipQ6NZC7 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sec23ipQ6NZC7 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sec23ipQ6NZC7 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sec23ipQ6NZC7 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sec23ipQ6NZC7 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sec23ipQ6NZC7 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sec23ipQ6NZC7 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sec23ipQ6NZC7 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sec23ipQ6NZC7 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sec23ipQ6NZC7 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sec23ipQ6NZC7 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sec23ipQ6NZC7 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sec23ipQ6NZC7 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sec23ipQ6NZC7 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sec23ipQ6NZC7 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sec23ipQ6NZC7 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sec23ipQ6NZC7 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sec23ipQ6NZC7 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sec23ipQ6NZC7 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sec23ipQ6NZC7 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sec23ipQ6NZC7 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sec23ipQ6NZC7 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Sec23ipQ6NZC7 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sec23ipQ6NZC7 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sec23ipQ6NZC7 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Sec23ipQ6NZC7 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sec23ipQ6NZC7 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sec23ipQ6NZC7 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sec23ipQ6NZC7 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sec23ipQ6NZC7 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sec23ipQ6NZC7 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sec23ipQ6NZC7 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Sec23ipQ6NZC7 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Sec23ipQ6NZC7 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sec23ipQ6NZC7 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sec23ipQ6NZC7 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sec23ipQ6NZC7 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sec23ipQ6NZC7 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sec23ipQ6NZC7 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sec23ipQ6NZC7 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sec23ipQ6NZC7 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sec23ipQ6NZC7 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sec23ipQ6NZC7 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sec23ipQ6NZC7 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sec23ipQ6NZC7 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sec23ipQ6NZC7 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sec23ipQ6NZC7 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sec23ipQ6NZC7 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Sec23ipQ6NZC7 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sec23ipQ6NZC7 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sec23ipQ6NZC7 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sec23ipQ6NZC7 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sec23ipQ6NZC7 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sec23ipQ6NZC7 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sec23ipQ6NZC7 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sec23ipQ6NZC7 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sec23ipQ6NZC7 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sec23ipQ6NZC7 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sec23ipQ6NZC7 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms