Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZA9

Taf9b, Transcription initiation factor TFIID subunit 9B, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf9bQ6NZA9 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Taf9bQ6NZA9 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Taf9bQ6NZA9 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Taf9bQ6NZA9 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Taf9bQ6NZA9 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Taf9bQ6NZA9 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Taf9bQ6NZA9 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Taf9bQ6NZA9 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Taf9bQ6NZA9 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Taf9bQ6NZA9 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Taf9bQ6NZA9 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Taf9bQ6NZA9 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Taf9bQ6NZA9 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Taf9bQ6NZA9 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Taf9bQ6NZA9 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Taf9bQ6NZA9 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Taf9bQ6NZA9 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Taf9bQ6NZA9 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf9bQ6NZA9 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf9bQ6NZA9 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf9bQ6NZA9 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf9bQ6NZA9 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf9bQ6NZA9 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf9bQ6NZA9 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf9bQ6NZA9 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf9bQ6NZA9 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf9bQ6NZA9 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf9bQ6NZA9 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf9bQ6NZA9 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf9bQ6NZA9 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf9bQ6NZA9 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf9bQ6NZA9 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf9bQ6NZA9 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf9bQ6NZA9 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf9bQ6NZA9 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf9bQ6NZA9 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf9bQ6NZA9 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf9bQ6NZA9 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf9bQ6NZA9 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf9bQ6NZA9 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf9bQ6NZA9 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf9bQ6NZA9 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf9bQ6NZA9 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf9bQ6NZA9 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf9bQ6NZA9 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf9bQ6NZA9 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf9bQ6NZA9 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf9bQ6NZA9 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf9bQ6NZA9 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf9bQ6NZA9 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf9bQ6NZA9 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf9bQ6NZA9 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf9bQ6NZA9 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf9bQ6NZA9 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf9bQ6NZA9 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf9bQ6NZA9 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf9bQ6NZA9 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf9bQ6NZA9 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf9bQ6NZA9 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf9bQ6NZA9 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf9bQ6NZA9 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf9bQ6NZA9 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf9bQ6NZA9 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf9bQ6NZA9 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf9bQ6NZA9 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf9bQ6NZA9 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf9bQ6NZA9 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf9bQ6NZA9 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf9bQ6NZA9 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf9bQ6NZA9 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf9bQ6NZA9 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf9bQ6NZA9 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf9bQ6NZA9 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf9bQ6NZA9 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf9bQ6NZA9 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf9bQ6NZA9 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf9bQ6NZA9 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf9bQ6NZA9 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf9bQ6NZA9 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf9bQ6NZA9 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf9bQ6NZA9 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf9bQ6NZA9 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf9bQ6NZA9 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf9bQ6NZA9 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf9bQ6NZA9 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf9bQ6NZA9 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf9bQ6NZA9 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf9bQ6NZA9 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf9bQ6NZA9 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf9bQ6NZA9 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf9bQ6NZA9 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf9bQ6NZA9 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf9bQ6NZA9 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf9bQ6NZA9 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf9bQ6NZA9 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf9bQ6NZA9 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf9bQ6NZA9 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf9bQ6NZA9 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf9bQ6NZA9 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Taf9bQ6NZA9 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms