Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXW6

Rad17, Cell cycle checkpoint protein RAD17, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad17Q6NXW6 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rad17Q6NXW6 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rad17Q6NXW6 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Rad17Q6NXW6 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rad17Q6NXW6 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Rad17Q6NXW6 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rad17Q6NXW6 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rad17Q6NXW6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rad17Q6NXW6 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rad17Q6NXW6 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rad17Q6NXW6 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rad17Q6NXW6 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rad17Q6NXW6 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rad17Q6NXW6 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rad17Q6NXW6 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rad17Q6NXW6 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rad17Q6NXW6 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rad17Q6NXW6 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rad17Q6NXW6 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rad17Q6NXW6 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rad17Q6NXW6 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rad17Q6NXW6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rad17Q6NXW6 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rad17Q6NXW6 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rad17Q6NXW6 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rad17Q6NXW6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rad17Q6NXW6 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rad17Q6NXW6 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rad17Q6NXW6 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Rad17Q6NXW6 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Rad17Q6NXW6 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rad17Q6NXW6 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rad17Q6NXW6 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rad17Q6NXW6 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rad17Q6NXW6 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rad17Q6NXW6 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rad17Q6NXW6 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Rad17Q6NXW6 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rad17Q6NXW6 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rad17Q6NXW6 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rad17Q6NXW6 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rad17Q6NXW6 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rad17Q6NXW6 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rad17Q6NXW6 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Rad17Q6NXW6 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rad17Q6NXW6 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Rad17Q6NXW6 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Rad17Q6NXW6 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rad17Q6NXW6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rad17Q6NXW6 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Rad17Q6NXW6 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rad17Q6NXW6 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rad17Q6NXW6 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rad17Q6NXW6 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rad17Q6NXW6 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rad17Q6NXW6 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rad17Q6NXW6 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rad17Q6NXW6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rad17Q6NXW6 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rad17Q6NXW6 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rad17Q6NXW6 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Rad17Q6NXW6 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rad17Q6NXW6 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rad17Q6NXW6 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rad17Q6NXW6 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rad17Q6NXW6 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rad17Q6NXW6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rad17Q6NXW6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rad17Q6NXW6 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rad17Q6NXW6 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rad17Q6NXW6 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Rad17Q6NXW6 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rad17Q6NXW6 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rad17Q6NXW6 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rad17Q6NXW6 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rad17Q6NXW6 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rad17Q6NXW6 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rad17Q6NXW6 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rad17Q6NXW6 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rad17Q6NXW6 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Rad17Q6NXW6 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Rad17Q6NXW6 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rad17Q6NXW6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rad17Q6NXW6 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rad17Q6NXW6 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rad17Q6NXW6 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rad17Q6NXW6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rad17Q6NXW6 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rad17Q6NXW6 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rad17Q6NXW6 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rad17Q6NXW6 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rad17Q6NXW6 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rad17Q6NXW6 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rad17Q6NXW6 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rad17Q6NXW6 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rad17Q6NXW6 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rad17Q6NXW6 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Rad17Q6NXW6 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rad17Q6NXW6 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rad17Q6NXW6 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms