Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CltbQ6IRU5 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms