Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRT3

Parpbp, PCNA-interacting partner, mousemouse

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParpbpQ6IRT3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ParpbpQ6IRT3 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ParpbpQ6IRT3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ParpbpQ6IRT3 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ParpbpQ6IRT3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ParpbpQ6IRT3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ParpbpQ6IRT3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ParpbpQ6IRT3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ParpbpQ6IRT3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ParpbpQ6IRT3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ParpbpQ6IRT3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ParpbpQ6IRT3 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ParpbpQ6IRT3 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ParpbpQ6IRT3 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ParpbpQ6IRT3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ParpbpQ6IRT3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ParpbpQ6IRT3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ParpbpQ6IRT3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ParpbpQ6IRT3 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ParpbpQ6IRT3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ParpbpQ6IRT3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ParpbpQ6IRT3 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ParpbpQ6IRT3 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ParpbpQ6IRT3 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ParpbpQ6IRT3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ParpbpQ6IRT3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ParpbpQ6IRT3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ParpbpQ6IRT3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ParpbpQ6IRT3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ParpbpQ6IRT3 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ParpbpQ6IRT3 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ParpbpQ6IRT3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ParpbpQ6IRT3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ParpbpQ6IRT3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ParpbpQ6IRT3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ParpbpQ6IRT3 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ParpbpQ6IRT3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ParpbpQ6IRT3 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ParpbpQ6IRT3 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ParpbpQ6IRT3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ParpbpQ6IRT3 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ParpbpQ6IRT3 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ParpbpQ6IRT3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ParpbpQ6IRT3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ParpbpQ6IRT3 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ParpbpQ6IRT3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ParpbpQ6IRT3 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ParpbpQ6IRT3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ParpbpQ6IRT3 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ParpbpQ6IRT3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ParpbpQ6IRT3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ParpbpQ6IRT3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ParpbpQ6IRT3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ParpbpQ6IRT3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ParpbpQ6IRT3 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ParpbpQ6IRT3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ParpbpQ6IRT3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ParpbpQ6IRT3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ParpbpQ6IRT3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ParpbpQ6IRT3 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ParpbpQ6IRT3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ParpbpQ6IRT3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ParpbpQ6IRT3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ParpbpQ6IRT3 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ParpbpQ6IRT3 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ParpbpQ6IRT3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ParpbpQ6IRT3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ParpbpQ6IRT3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ParpbpQ6IRT3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ParpbpQ6IRT3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ParpbpQ6IRT3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ParpbpQ6IRT3 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ParpbpQ6IRT3 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ParpbpQ6IRT3 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ParpbpQ6IRT3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ParpbpQ6IRT3 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ParpbpQ6IRT3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ParpbpQ6IRT3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ParpbpQ6IRT3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ParpbpQ6IRT3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ParpbpQ6IRT3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ParpbpQ6IRT3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ParpbpQ6IRT3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ParpbpQ6IRT3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ParpbpQ6IRT3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ParpbpQ6IRT3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ParpbpQ6IRT3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ParpbpQ6IRT3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ParpbpQ6IRT3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ParpbpQ6IRT3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ParpbpQ6IRT3 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ParpbpQ6IRT3 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ParpbpQ6IRT3 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ParpbpQ6IRT3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ParpbpQ6IRT3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ParpbpQ6IRT3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ParpbpQ6IRT3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ParpbpQ6IRT3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ParpbpQ6IRT3 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ParpbpQ6IRT3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms