Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQX2

Nckap5l, Nck-associated protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nckap5lQ6GQX2 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nckap5lQ6GQX2 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Nckap5lQ6GQX2 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nckap5lQ6GQX2 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nckap5lQ6GQX2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nckap5lQ6GQX2 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nckap5lQ6GQX2 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nckap5lQ6GQX2 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nckap5lQ6GQX2 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nckap5lQ6GQX2 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nckap5lQ6GQX2 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nckap5lQ6GQX2 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nckap5lQ6GQX2 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nckap5lQ6GQX2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nckap5lQ6GQX2 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nckap5lQ6GQX2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nckap5lQ6GQX2 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nckap5lQ6GQX2 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nckap5lQ6GQX2 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nckap5lQ6GQX2 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nckap5lQ6GQX2 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nckap5lQ6GQX2 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nckap5lQ6GQX2 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Nckap5lQ6GQX2 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Nckap5lQ6GQX2 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Nckap5lQ6GQX2 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nckap5lQ6GQX2 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Nckap5lQ6GQX2 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Nckap5lQ6GQX2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nckap5lQ6GQX2 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nckap5lQ6GQX2 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nckap5lQ6GQX2 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nckap5lQ6GQX2 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nckap5lQ6GQX2 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nckap5lQ6GQX2 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nckap5lQ6GQX2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nckap5lQ6GQX2 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nckap5lQ6GQX2 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nckap5lQ6GQX2 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nckap5lQ6GQX2 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nckap5lQ6GQX2 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nckap5lQ6GQX2 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nckap5lQ6GQX2 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Nckap5lQ6GQX2 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nckap5lQ6GQX2 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nckap5lQ6GQX2 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nckap5lQ6GQX2 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nckap5lQ6GQX2 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nckap5lQ6GQX2 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nckap5lQ6GQX2 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nckap5lQ6GQX2 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nckap5lQ6GQX2 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nckap5lQ6GQX2 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nckap5lQ6GQX2 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Nckap5lQ6GQX2 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nckap5lQ6GQX2 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nckap5lQ6GQX2 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nckap5lQ6GQX2 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nckap5lQ6GQX2 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nckap5lQ6GQX2 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nckap5lQ6GQX2 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nckap5lQ6GQX2 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nckap5lQ6GQX2 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Nckap5lQ6GQX2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nckap5lQ6GQX2 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nckap5lQ6GQX2 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nckap5lQ6GQX2 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nckap5lQ6GQX2 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nckap5lQ6GQX2 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nckap5lQ6GQX2 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nckap5lQ6GQX2 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nckap5lQ6GQX2 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nckap5lQ6GQX2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nckap5lQ6GQX2 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nckap5lQ6GQX2 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nckap5lQ6GQX2 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Nckap5lQ6GQX2 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nckap5lQ6GQX2 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Nckap5lQ6GQX2 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Nckap5lQ6GQX2 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Nckap5lQ6GQX2 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nckap5lQ6GQX2 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nckap5lQ6GQX2 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Nckap5lQ6GQX2 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nckap5lQ6GQX2 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nckap5lQ6GQX2 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nckap5lQ6GQX2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nckap5lQ6GQX2 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Nckap5lQ6GQX2 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nckap5lQ6GQX2 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nckap5lQ6GQX2 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nckap5lQ6GQX2 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Nckap5lQ6GQX2 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nckap5lQ6GQX2 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nckap5lQ6GQX2 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nckap5lQ6GQX2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nckap5lQ6GQX2 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nckap5lQ6GQX2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nckap5lQ6GQX2 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nckap5lQ6GQX2 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms