Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg9bQ6EBV9 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg9bQ6EBV9 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg9bQ6EBV9 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg9bQ6EBV9 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg9bQ6EBV9 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Atg9bQ6EBV9 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg9bQ6EBV9 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg9bQ6EBV9 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg9bQ6EBV9 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg9bQ6EBV9 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg9bQ6EBV9 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg9bQ6EBV9 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg9bQ6EBV9 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg9bQ6EBV9 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg9bQ6EBV9 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg9bQ6EBV9 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg9bQ6EBV9 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg9bQ6EBV9 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg9bQ6EBV9 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg9bQ6EBV9 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg9bQ6EBV9 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg9bQ6EBV9 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg9bQ6EBV9 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg9bQ6EBV9 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg9bQ6EBV9 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg9bQ6EBV9 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg9bQ6EBV9 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg9bQ6EBV9 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg9bQ6EBV9 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg9bQ6EBV9 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg9bQ6EBV9 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg9bQ6EBV9 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg9bQ6EBV9 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg9bQ6EBV9 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg9bQ6EBV9 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg9bQ6EBV9 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg9bQ6EBV9 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg9bQ6EBV9 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg9bQ6EBV9 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg9bQ6EBV9 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg9bQ6EBV9 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg9bQ6EBV9 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg9bQ6EBV9 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg9bQ6EBV9 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg9bQ6EBV9 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg9bQ6EBV9 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg9bQ6EBV9 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg9bQ6EBV9 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg9bQ6EBV9 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg9bQ6EBV9 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg9bQ6EBV9 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg9bQ6EBV9 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg9bQ6EBV9 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg9bQ6EBV9 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg9bQ6EBV9 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg9bQ6EBV9 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg9bQ6EBV9 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg9bQ6EBV9 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg9bQ6EBV9 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg9bQ6EBV9 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg9bQ6EBV9 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg9bQ6EBV9 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg9bQ6EBV9 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg9bQ6EBV9 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg9bQ6EBV9 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg9bQ6EBV9 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg9bQ6EBV9 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg9bQ6EBV9 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg9bQ6EBV9 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg9bQ6EBV9 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg9bQ6EBV9 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg9bQ6EBV9 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg9bQ6EBV9 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg9bQ6EBV9 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg9bQ6EBV9 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg9bQ6EBV9 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg9bQ6EBV9 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg9bQ6EBV9 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg9bQ6EBV9 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg9bQ6EBV9 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg9bQ6EBV9 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg9bQ6EBV9 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg9bQ6EBV9 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg9bQ6EBV9 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg9bQ6EBV9 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg9bQ6EBV9 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg9bQ6EBV9 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg9bQ6EBV9 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg9bQ6EBV9 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg9bQ6EBV9 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg9bQ6EBV9 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg9bQ6EBV9 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg9bQ6EBV9 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg9bQ6EBV9 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg9bQ6EBV9 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg9bQ6EBV9 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg9bQ6EBV9 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg9bQ6EBV9 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg9bQ6EBV9 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms