Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nop58Q6DFW4 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nop58Q6DFW4 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nop58Q6DFW4 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nop58Q6DFW4 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nop58Q6DFW4 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nop58Q6DFW4 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nop58Q6DFW4 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nop58Q6DFW4 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nop58Q6DFW4 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nop58Q6DFW4 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nop58Q6DFW4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nop58Q6DFW4 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nop58Q6DFW4 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nop58Q6DFW4 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nop58Q6DFW4 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nop58Q6DFW4 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nop58Q6DFW4 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nop58Q6DFW4 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nop58Q6DFW4 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nop58Q6DFW4 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nop58Q6DFW4 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nop58Q6DFW4 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nop58Q6DFW4 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nop58Q6DFW4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nop58Q6DFW4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nop58Q6DFW4 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Nop58Q6DFW4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nop58Q6DFW4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nop58Q6DFW4 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nop58Q6DFW4 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nop58Q6DFW4 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nop58Q6DFW4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nop58Q6DFW4 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nop58Q6DFW4 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nop58Q6DFW4 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Nop58Q6DFW4 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nop58Q6DFW4 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nop58Q6DFW4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nop58Q6DFW4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nop58Q6DFW4 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nop58Q6DFW4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Nop58Q6DFW4 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nop58Q6DFW4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nop58Q6DFW4 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nop58Q6DFW4 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nop58Q6DFW4 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nop58Q6DFW4 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nop58Q6DFW4 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nop58Q6DFW4 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nop58Q6DFW4 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nop58Q6DFW4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nop58Q6DFW4 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nop58Q6DFW4 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nop58Q6DFW4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Nop58Q6DFW4 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nop58Q6DFW4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nop58Q6DFW4 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nop58Q6DFW4 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nop58Q6DFW4 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nop58Q6DFW4 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nop58Q6DFW4 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nop58Q6DFW4 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nop58Q6DFW4 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nop58Q6DFW4 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nop58Q6DFW4 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nop58Q6DFW4 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nop58Q6DFW4 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nop58Q6DFW4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nop58Q6DFW4 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nop58Q6DFW4 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nop58Q6DFW4 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Nop58Q6DFW4 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nop58Q6DFW4 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nop58Q6DFW4 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nop58Q6DFW4 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nop58Q6DFW4 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nop58Q6DFW4 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nop58Q6DFW4 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nop58Q6DFW4 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nop58Q6DFW4 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nop58Q6DFW4 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nop58Q6DFW4 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nop58Q6DFW4 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nop58Q6DFW4 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nop58Q6DFW4 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nop58Q6DFW4 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nop58Q6DFW4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Nop58Q6DFW4 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nop58Q6DFW4 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nop58Q6DFW4 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Nop58Q6DFW4 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nop58Q6DFW4 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nop58Q6DFW4 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nop58Q6DFW4 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nop58Q6DFW4 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nop58Q6DFW4 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nop58Q6DFW4 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nop58Q6DFW4 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nop58Q6DFW4 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms