Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q6DFW0 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q6DFW0 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q6DFW0 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q6DFW0 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q6DFW0 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q6DFW0 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q6DFW0 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q6DFW0 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q6DFW0 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q6DFW0 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q6DFW0 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q6DFW0 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q6DFW0 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q6DFW0 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Q6DFW0 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q6DFW0 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q6DFW0 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q6DFW0 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q6DFW0 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q6DFW0 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q6DFW0 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Q6DFW0 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q6DFW0 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q6DFW0 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q6DFW0 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q6DFW0 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Q6DFW0 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q6DFW0 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q6DFW0 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q6DFW0 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q6DFW0 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q6DFW0 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q6DFW0 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q6DFW0 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q6DFW0 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Q6DFW0 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q6DFW0 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q6DFW0 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q6DFW0 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q6DFW0 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q6DFW0 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q6DFW0 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q6DFW0 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q6DFW0 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q6DFW0 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q6DFW0 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q6DFW0 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q6DFW0 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q6DFW0 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Q6DFW0 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q6DFW0 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q6DFW0 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q6DFW0 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q6DFW0 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q6DFW0 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q6DFW0 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q6DFW0 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q6DFW0 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q6DFW0 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q6DFW0 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q6DFW0 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q6DFW0 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Q6DFW0 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q6DFW0 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q6DFW0 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q6DFW0 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q6DFW0 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q6DFW0 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q6DFW0 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q6DFW0 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q6DFW0 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q6DFW0 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q6DFW0 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q6DFW0 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q6DFW0 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q6DFW0 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q6DFW0 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q6DFW0 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q6DFW0 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q6DFW0 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q6DFW0 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q6DFW0 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q6DFW0 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q6DFW0 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q6DFW0 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q6DFW0 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q6DFW0 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q6DFW0 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q6DFW0 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q6DFW0 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q6DFW0 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q6DFW0 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q6DFW0 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q6DFW0 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q6DFW0 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q6DFW0 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q6DFW0 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q6DFW0 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q6DFW0 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
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