Protein–RNA interactions for Protein: Q6A028

Swap70, Switch-associated protein 70, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swap70Q6A028 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Swap70Q6A028 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Swap70Q6A028 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Swap70Q6A028 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Swap70Q6A028 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Swap70Q6A028 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Swap70Q6A028 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Swap70Q6A028 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Swap70Q6A028 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Swap70Q6A028 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Swap70Q6A028 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Swap70Q6A028 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Swap70Q6A028 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Swap70Q6A028 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Swap70Q6A028 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Swap70Q6A028 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Swap70Q6A028 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Swap70Q6A028 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Swap70Q6A028 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Swap70Q6A028 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Swap70Q6A028 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Swap70Q6A028 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Swap70Q6A028 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Swap70Q6A028 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Swap70Q6A028 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Swap70Q6A028 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Swap70Q6A028 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Swap70Q6A028 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Swap70Q6A028 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Swap70Q6A028 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Swap70Q6A028 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Swap70Q6A028 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Swap70Q6A028 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Swap70Q6A028 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Swap70Q6A028 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Swap70Q6A028 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Swap70Q6A028 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Swap70Q6A028 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Swap70Q6A028 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Swap70Q6A028 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Swap70Q6A028 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Swap70Q6A028 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Swap70Q6A028 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Swap70Q6A028 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Swap70Q6A028 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Swap70Q6A028 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Swap70Q6A028 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Swap70Q6A028 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Swap70Q6A028 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Swap70Q6A028 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Swap70Q6A028 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Swap70Q6A028 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Swap70Q6A028 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Swap70Q6A028 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Swap70Q6A028 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Swap70Q6A028 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Swap70Q6A028 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Swap70Q6A028 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Swap70Q6A028 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Swap70Q6A028 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Swap70Q6A028 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Swap70Q6A028 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Swap70Q6A028 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Swap70Q6A028 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Swap70Q6A028 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Swap70Q6A028 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Swap70Q6A028 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Swap70Q6A028 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Swap70Q6A028 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Swap70Q6A028 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Swap70Q6A028 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Swap70Q6A028 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Swap70Q6A028 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Swap70Q6A028 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Swap70Q6A028 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Swap70Q6A028 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Swap70Q6A028 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Swap70Q6A028 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Swap70Q6A028 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Swap70Q6A028 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Swap70Q6A028 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Swap70Q6A028 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Swap70Q6A028 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Swap70Q6A028 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Swap70Q6A028 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Swap70Q6A028 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Swap70Q6A028 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Swap70Q6A028 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Swap70Q6A028 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Swap70Q6A028 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Swap70Q6A028 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Swap70Q6A028 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Swap70Q6A028 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Swap70Q6A028 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Swap70Q6A028 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Swap70Q6A028 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Swap70Q6A028 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Swap70Q6A028 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Swap70Q6A028 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Swap70Q6A028 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms