Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z26

Cntn4, Contactin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn4Q69Z26 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cntn4Q69Z26 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cntn4Q69Z26 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cntn4Q69Z26 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cntn4Q69Z26 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cntn4Q69Z26 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cntn4Q69Z26 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cntn4Q69Z26 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cntn4Q69Z26 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cntn4Q69Z26 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cntn4Q69Z26 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cntn4Q69Z26 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cntn4Q69Z26 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cntn4Q69Z26 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cntn4Q69Z26 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cntn4Q69Z26 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cntn4Q69Z26 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cntn4Q69Z26 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cntn4Q69Z26 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cntn4Q69Z26 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cntn4Q69Z26 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cntn4Q69Z26 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cntn4Q69Z26 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cntn4Q69Z26 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cntn4Q69Z26 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cntn4Q69Z26 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cntn4Q69Z26 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cntn4Q69Z26 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cntn4Q69Z26 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cntn4Q69Z26 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cntn4Q69Z26 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cntn4Q69Z26 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cntn4Q69Z26 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cntn4Q69Z26 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cntn4Q69Z26 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cntn4Q69Z26 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cntn4Q69Z26 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cntn4Q69Z26 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cntn4Q69Z26 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cntn4Q69Z26 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cntn4Q69Z26 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cntn4Q69Z26 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cntn4Q69Z26 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cntn4Q69Z26 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cntn4Q69Z26 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cntn4Q69Z26 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cntn4Q69Z26 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cntn4Q69Z26 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Cntn4Q69Z26 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Cntn4Q69Z26 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cntn4Q69Z26 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cntn4Q69Z26 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cntn4Q69Z26 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cntn4Q69Z26 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cntn4Q69Z26 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cntn4Q69Z26 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cntn4Q69Z26 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cntn4Q69Z26 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cntn4Q69Z26 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cntn4Q69Z26 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cntn4Q69Z26 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cntn4Q69Z26 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Cntn4Q69Z26 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cntn4Q69Z26 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cntn4Q69Z26 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cntn4Q69Z26 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cntn4Q69Z26 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cntn4Q69Z26 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cntn4Q69Z26 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cntn4Q69Z26 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cntn4Q69Z26 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cntn4Q69Z26 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cntn4Q69Z26 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cntn4Q69Z26 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cntn4Q69Z26 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cntn4Q69Z26 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cntn4Q69Z26 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cntn4Q69Z26 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cntn4Q69Z26 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cntn4Q69Z26 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cntn4Q69Z26 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cntn4Q69Z26 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cntn4Q69Z26 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cntn4Q69Z26 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cntn4Q69Z26 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cntn4Q69Z26 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cntn4Q69Z26 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cntn4Q69Z26 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cntn4Q69Z26 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cntn4Q69Z26 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cntn4Q69Z26 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cntn4Q69Z26 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cntn4Q69Z26 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cntn4Q69Z26 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cntn4Q69Z26 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cntn4Q69Z26 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cntn4Q69Z26 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cntn4Q69Z26 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cntn4Q69Z26 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cntn4Q69Z26 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms