Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG2

Sptbn2, Spectrin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn2Q68FG2 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Sptbn2Q68FG2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sptbn2Q68FG2 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sptbn2Q68FG2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sptbn2Q68FG2 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sptbn2Q68FG2 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sptbn2Q68FG2 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sptbn2Q68FG2 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sptbn2Q68FG2 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sptbn2Q68FG2 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sptbn2Q68FG2 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sptbn2Q68FG2 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sptbn2Q68FG2 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sptbn2Q68FG2 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sptbn2Q68FG2 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sptbn2Q68FG2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sptbn2Q68FG2 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sptbn2Q68FG2 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sptbn2Q68FG2 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sptbn2Q68FG2 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sptbn2Q68FG2 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sptbn2Q68FG2 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sptbn2Q68FG2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sptbn2Q68FG2 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sptbn2Q68FG2 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sptbn2Q68FG2 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sptbn2Q68FG2 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sptbn2Q68FG2 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sptbn2Q68FG2 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sptbn2Q68FG2 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sptbn2Q68FG2 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sptbn2Q68FG2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sptbn2Q68FG2 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sptbn2Q68FG2 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sptbn2Q68FG2 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sptbn2Q68FG2 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sptbn2Q68FG2 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sptbn2Q68FG2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sptbn2Q68FG2 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sptbn2Q68FG2 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sptbn2Q68FG2 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sptbn2Q68FG2 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sptbn2Q68FG2 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sptbn2Q68FG2 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sptbn2Q68FG2 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sptbn2Q68FG2 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sptbn2Q68FG2 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sptbn2Q68FG2 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sptbn2Q68FG2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sptbn2Q68FG2 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sptbn2Q68FG2 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sptbn2Q68FG2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sptbn2Q68FG2 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sptbn2Q68FG2 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sptbn2Q68FG2 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sptbn2Q68FG2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sptbn2Q68FG2 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sptbn2Q68FG2 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sptbn2Q68FG2 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sptbn2Q68FG2 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sptbn2Q68FG2 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sptbn2Q68FG2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sptbn2Q68FG2 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sptbn2Q68FG2 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sptbn2Q68FG2 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sptbn2Q68FG2 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sptbn2Q68FG2 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sptbn2Q68FG2 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sptbn2Q68FG2 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sptbn2Q68FG2 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sptbn2Q68FG2 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sptbn2Q68FG2 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sptbn2Q68FG2 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sptbn2Q68FG2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sptbn2Q68FG2 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sptbn2Q68FG2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sptbn2Q68FG2 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sptbn2Q68FG2 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sptbn2Q68FG2 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sptbn2Q68FG2 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sptbn2Q68FG2 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sptbn2Q68FG2 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sptbn2Q68FG2 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sptbn2Q68FG2 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sptbn2Q68FG2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sptbn2Q68FG2 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sptbn2Q68FG2 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sptbn2Q68FG2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sptbn2Q68FG2 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sptbn2Q68FG2 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sptbn2Q68FG2 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sptbn2Q68FG2 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sptbn2Q68FG2 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sptbn2Q68FG2 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sptbn2Q68FG2 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sptbn2Q68FG2 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sptbn2Q68FG2 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sptbn2Q68FG2 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sptbn2Q68FG2 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sptbn2Q68FG2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms