Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD7

Fnip1, Folliculin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fnip1Q68FD7 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fnip1Q68FD7 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fnip1Q68FD7 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fnip1Q68FD7 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fnip1Q68FD7 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fnip1Q68FD7 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fnip1Q68FD7 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Fnip1Q68FD7 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fnip1Q68FD7 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fnip1Q68FD7 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fnip1Q68FD7 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fnip1Q68FD7 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fnip1Q68FD7 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Fnip1Q68FD7 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fnip1Q68FD7 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fnip1Q68FD7 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fnip1Q68FD7 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fnip1Q68FD7 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fnip1Q68FD7 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fnip1Q68FD7 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fnip1Q68FD7 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fnip1Q68FD7 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fnip1Q68FD7 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fnip1Q68FD7 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fnip1Q68FD7 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fnip1Q68FD7 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fnip1Q68FD7 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fnip1Q68FD7 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fnip1Q68FD7 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fnip1Q68FD7 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Fnip1Q68FD7 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fnip1Q68FD7 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fnip1Q68FD7 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fnip1Q68FD7 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fnip1Q68FD7 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fnip1Q68FD7 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Fnip1Q68FD7 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fnip1Q68FD7 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fnip1Q68FD7 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fnip1Q68FD7 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Fnip1Q68FD7 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fnip1Q68FD7 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fnip1Q68FD7 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fnip1Q68FD7 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fnip1Q68FD7 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fnip1Q68FD7 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fnip1Q68FD7 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fnip1Q68FD7 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fnip1Q68FD7 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fnip1Q68FD7 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fnip1Q68FD7 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fnip1Q68FD7 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fnip1Q68FD7 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fnip1Q68FD7 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fnip1Q68FD7 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fnip1Q68FD7 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fnip1Q68FD7 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fnip1Q68FD7 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fnip1Q68FD7 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fnip1Q68FD7 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Fnip1Q68FD7 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fnip1Q68FD7 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fnip1Q68FD7 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fnip1Q68FD7 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fnip1Q68FD7 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fnip1Q68FD7 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fnip1Q68FD7 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fnip1Q68FD7 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fnip1Q68FD7 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fnip1Q68FD7 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fnip1Q68FD7 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Fnip1Q68FD7 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fnip1Q68FD7 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fnip1Q68FD7 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fnip1Q68FD7 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Fnip1Q68FD7 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fnip1Q68FD7 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fnip1Q68FD7 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fnip1Q68FD7 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fnip1Q68FD7 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fnip1Q68FD7 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fnip1Q68FD7 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fnip1Q68FD7 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fnip1Q68FD7 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fnip1Q68FD7 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fnip1Q68FD7 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fnip1Q68FD7 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fnip1Q68FD7 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fnip1Q68FD7 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fnip1Q68FD7 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fnip1Q68FD7 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fnip1Q68FD7 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fnip1Q68FD7 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fnip1Q68FD7 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fnip1Q68FD7 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fnip1Q68FD7 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fnip1Q68FD7 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fnip1Q68FD7 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fnip1Q68FD7 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fnip1Q68FD7 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms