Protein–RNA interactions for Protein: Q66JY2

Ino80d, INO80 complex subunit D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80dQ66JY2 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ino80dQ66JY2 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ino80dQ66JY2 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ino80dQ66JY2 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ino80dQ66JY2 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ino80dQ66JY2 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ino80dQ66JY2 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ino80dQ66JY2 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ino80dQ66JY2 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ino80dQ66JY2 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ino80dQ66JY2 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ino80dQ66JY2 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ino80dQ66JY2 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ino80dQ66JY2 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ino80dQ66JY2 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ino80dQ66JY2 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ino80dQ66JY2 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ino80dQ66JY2 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ino80dQ66JY2 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ino80dQ66JY2 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ino80dQ66JY2 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ino80dQ66JY2 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ino80dQ66JY2 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ino80dQ66JY2 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ino80dQ66JY2 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ino80dQ66JY2 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ino80dQ66JY2 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ino80dQ66JY2 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ino80dQ66JY2 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ino80dQ66JY2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ino80dQ66JY2 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ino80dQ66JY2 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ino80dQ66JY2 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ino80dQ66JY2 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ino80dQ66JY2 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ino80dQ66JY2 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
Ino80dQ66JY2 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ino80dQ66JY2 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ino80dQ66JY2 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ino80dQ66JY2 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ino80dQ66JY2 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ino80dQ66JY2 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ino80dQ66JY2 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ino80dQ66JY2 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ino80dQ66JY2 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ino80dQ66JY2 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ino80dQ66JY2 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ino80dQ66JY2 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ino80dQ66JY2 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ino80dQ66JY2 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ino80dQ66JY2 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ino80dQ66JY2 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ino80dQ66JY2 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ino80dQ66JY2 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ino80dQ66JY2 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ino80dQ66JY2 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ino80dQ66JY2 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ino80dQ66JY2 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ino80dQ66JY2 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ino80dQ66JY2 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ino80dQ66JY2 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ino80dQ66JY2 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ino80dQ66JY2 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ino80dQ66JY2 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ino80dQ66JY2 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ino80dQ66JY2 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ino80dQ66JY2 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ino80dQ66JY2 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ino80dQ66JY2 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ino80dQ66JY2 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ino80dQ66JY2 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ino80dQ66JY2 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ino80dQ66JY2 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ino80dQ66JY2 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ino80dQ66JY2 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ino80dQ66JY2 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ino80dQ66JY2 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ino80dQ66JY2 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ino80dQ66JY2 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ino80dQ66JY2 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ino80dQ66JY2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ino80dQ66JY2 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ino80dQ66JY2 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ino80dQ66JY2 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ino80dQ66JY2 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ino80dQ66JY2 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ino80dQ66JY2 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ino80dQ66JY2 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ino80dQ66JY2 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ino80dQ66JY2 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ino80dQ66JY2 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ino80dQ66JY2 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ino80dQ66JY2 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ino80dQ66JY2 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ino80dQ66JY2 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ino80dQ66JY2 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ino80dQ66JY2 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ino80dQ66JY2 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ino80dQ66JY2 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ino80dQ66JY2 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms