Protein–RNA interactions for Protein: Q64727

Vcl, Vinculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VclQ64727 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VclQ64727 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VclQ64727 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VclQ64727 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VclQ64727 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
VclQ64727 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
VclQ64727 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VclQ64727 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VclQ64727 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VclQ64727 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VclQ64727 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VclQ64727 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VclQ64727 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VclQ64727 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VclQ64727 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VclQ64727 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
VclQ64727 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VclQ64727 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VclQ64727 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VclQ64727 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VclQ64727 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VclQ64727 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VclQ64727 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VclQ64727 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VclQ64727 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VclQ64727 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VclQ64727 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VclQ64727 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VclQ64727 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VclQ64727 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VclQ64727 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VclQ64727 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VclQ64727 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VclQ64727 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VclQ64727 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VclQ64727 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VclQ64727 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
VclQ64727 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VclQ64727 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VclQ64727 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VclQ64727 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VclQ64727 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VclQ64727 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VclQ64727 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VclQ64727 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VclQ64727 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VclQ64727 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VclQ64727 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VclQ64727 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VclQ64727 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VclQ64727 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VclQ64727 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VclQ64727 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
VclQ64727 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VclQ64727 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
VclQ64727 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VclQ64727 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VclQ64727 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VclQ64727 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VclQ64727 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VclQ64727 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VclQ64727 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VclQ64727 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
VclQ64727 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VclQ64727 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VclQ64727 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VclQ64727 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VclQ64727 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
VclQ64727 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
VclQ64727 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
VclQ64727 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
VclQ64727 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
VclQ64727 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VclQ64727 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VclQ64727 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VclQ64727 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VclQ64727 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VclQ64727 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VclQ64727 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VclQ64727 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VclQ64727 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VclQ64727 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VclQ64727 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VclQ64727 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VclQ64727 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VclQ64727 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VclQ64727 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VclQ64727 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VclQ64727 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VclQ64727 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VclQ64727 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VclQ64727 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VclQ64727 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VclQ64727 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VclQ64727 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VclQ64727 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VclQ64727 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
VclQ64727 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VclQ64727 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VclQ64727 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms