Protein–RNA interactions for Protein: Q64674

Srm, Spermidine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrmQ64674 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrmQ64674 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrmQ64674 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrmQ64674 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrmQ64674 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrmQ64674 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrmQ64674 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrmQ64674 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrmQ64674 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrmQ64674 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrmQ64674 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrmQ64674 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrmQ64674 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrmQ64674 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrmQ64674 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrmQ64674 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrmQ64674 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrmQ64674 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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SrmQ64674 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrmQ64674 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrmQ64674 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrmQ64674 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrmQ64674 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrmQ64674 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrmQ64674 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrmQ64674 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrmQ64674 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrmQ64674 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrmQ64674 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrmQ64674 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrmQ64674 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrmQ64674 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrmQ64674 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrmQ64674 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrmQ64674 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrmQ64674 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrmQ64674 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrmQ64674 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrmQ64674 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrmQ64674 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrmQ64674 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrmQ64674 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrmQ64674 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrmQ64674 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrmQ64674 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrmQ64674 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrmQ64674 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrmQ64674 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrmQ64674 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrmQ64674 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrmQ64674 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrmQ64674 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrmQ64674 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrmQ64674 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SrmQ64674 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SrmQ64674 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrmQ64674 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrmQ64674 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrmQ64674 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrmQ64674 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrmQ64674 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrmQ64674 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrmQ64674 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrmQ64674 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrmQ64674 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrmQ64674 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrmQ64674 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrmQ64674 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrmQ64674 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrmQ64674 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrmQ64674 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrmQ64674 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrmQ64674 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrmQ64674 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrmQ64674 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrmQ64674 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrmQ64674 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SrmQ64674 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrmQ64674 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SrmQ64674 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrmQ64674 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrmQ64674 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrmQ64674 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrmQ64674 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrmQ64674 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrmQ64674 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrmQ64674 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrmQ64674 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrmQ64674 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrmQ64674 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrmQ64674 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrmQ64674 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrmQ64674 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrmQ64674 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrmQ64674 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrmQ64674 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrmQ64674 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrmQ64674 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrmQ64674 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms