Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtprdQ64487 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtprdQ64487 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtprdQ64487 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtprdQ64487 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PtprdQ64487 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtprdQ64487 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PtprdQ64487 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtprdQ64487 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtprdQ64487 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtprdQ64487 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtprdQ64487 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprdQ64487 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprdQ64487 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprdQ64487 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprdQ64487 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprdQ64487 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprdQ64487 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprdQ64487 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprdQ64487 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprdQ64487 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprdQ64487 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprdQ64487 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprdQ64487 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprdQ64487 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprdQ64487 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprdQ64487 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprdQ64487 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprdQ64487 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprdQ64487 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprdQ64487 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprdQ64487 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprdQ64487 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprdQ64487 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprdQ64487 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprdQ64487 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprdQ64487 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprdQ64487 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprdQ64487 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprdQ64487 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprdQ64487 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprdQ64487 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprdQ64487 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprdQ64487 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprdQ64487 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprdQ64487 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprdQ64487 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprdQ64487 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprdQ64487 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprdQ64487 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprdQ64487 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprdQ64487 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprdQ64487 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprdQ64487 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprdQ64487 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprdQ64487 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprdQ64487 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprdQ64487 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprdQ64487 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprdQ64487 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprdQ64487 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprdQ64487 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprdQ64487 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprdQ64487 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprdQ64487 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprdQ64487 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprdQ64487 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprdQ64487 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprdQ64487 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprdQ64487 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprdQ64487 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprdQ64487 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprdQ64487 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprdQ64487 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprdQ64487 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprdQ64487 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprdQ64487 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprdQ64487 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprdQ64487 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprdQ64487 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprdQ64487 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprdQ64487 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprdQ64487 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprdQ64487 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PtprdQ64487 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PtprdQ64487 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PtprdQ64487 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PtprdQ64487 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PtprdQ64487 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PtprdQ64487 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprdQ64487 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprdQ64487 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprdQ64487 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprdQ64487 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprdQ64487 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprdQ64487 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprdQ64487 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprdQ64487 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprdQ64487 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprdQ64487 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms