Protein–RNA interactions for Protein: Q64455

Ptprj, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, mousemouse

Predictions only

Length 1,238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprjQ64455 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprjQ64455 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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PtprjQ64455 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprjQ64455 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprjQ64455 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprjQ64455 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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PtprjQ64455 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtprjQ64455 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtprjQ64455 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PtprjQ64455 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtprjQ64455 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtprjQ64455 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtprjQ64455 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms