Protein–RNA interactions for Protein: Q64448

Gja3, Gap junction alpha-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja3Q64448 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Gja3Q64448 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gja3Q64448 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gja3Q64448 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gja3Q64448 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gja3Q64448 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gja3Q64448 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gja3Q64448 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Gja3Q64448 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gja3Q64448 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gja3Q64448 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gja3Q64448 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gja3Q64448 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gja3Q64448 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gja3Q64448 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gja3Q64448 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gja3Q64448 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gja3Q64448 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gja3Q64448 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gja3Q64448 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gja3Q64448 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gja3Q64448 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gja3Q64448 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gja3Q64448 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gja3Q64448 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gja3Q64448 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gja3Q64448 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gja3Q64448 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gja3Q64448 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gja3Q64448 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gja3Q64448 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gja3Q64448 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gja3Q64448 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gja3Q64448 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gja3Q64448 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gja3Q64448 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gja3Q64448 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gja3Q64448 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gja3Q64448 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gja3Q64448 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gja3Q64448 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gja3Q64448 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gja3Q64448 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gja3Q64448 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gja3Q64448 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gja3Q64448 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gja3Q64448 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gja3Q64448 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gja3Q64448 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gja3Q64448 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gja3Q64448 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gja3Q64448 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gja3Q64448 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gja3Q64448 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gja3Q64448 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gja3Q64448 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gja3Q64448 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gja3Q64448 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gja3Q64448 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gja3Q64448 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gja3Q64448 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Gja3Q64448 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gja3Q64448 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gja3Q64448 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gja3Q64448 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gja3Q64448 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gja3Q64448 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gja3Q64448 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Gja3Q64448 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gja3Q64448 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Gja3Q64448 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gja3Q64448 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gja3Q64448 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gja3Q64448 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gja3Q64448 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gja3Q64448 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gja3Q64448 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gja3Q64448 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gja3Q64448 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gja3Q64448 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Gja3Q64448 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gja3Q64448 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gja3Q64448 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gja3Q64448 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gja3Q64448 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gja3Q64448 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gja3Q64448 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gja3Q64448 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gja3Q64448 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gja3Q64448 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gja3Q64448 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gja3Q64448 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gja3Q64448 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gja3Q64448 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Gja3Q64448 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gja3Q64448 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Gja3Q64448 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gja3Q64448 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gja3Q64448 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gja3Q64448 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms