Protein–RNA interactions for Protein: Q64253

Ly6e, Lymphocyte antigen 6E, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6eQ64253 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ly6eQ64253 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ly6eQ64253 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ly6eQ64253 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ly6eQ64253 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ly6eQ64253 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ly6eQ64253 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ly6eQ64253 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ly6eQ64253 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ly6eQ64253 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ly6eQ64253 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ly6eQ64253 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ly6eQ64253 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ly6eQ64253 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ly6eQ64253 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ly6eQ64253 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ly6eQ64253 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ly6eQ64253 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ly6eQ64253 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ly6eQ64253 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ly6eQ64253 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ly6eQ64253 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ly6eQ64253 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ly6eQ64253 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ly6eQ64253 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ly6eQ64253 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ly6eQ64253 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ly6eQ64253 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ly6eQ64253 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ly6eQ64253 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ly6eQ64253 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ly6eQ64253 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ly6eQ64253 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ly6eQ64253 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ly6eQ64253 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ly6eQ64253 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ly6eQ64253 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ly6eQ64253 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ly6eQ64253 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ly6eQ64253 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ly6eQ64253 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ly6eQ64253 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ly6eQ64253 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ly6eQ64253 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ly6eQ64253 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ly6eQ64253 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ly6eQ64253 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ly6eQ64253 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ly6eQ64253 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ly6eQ64253 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ly6eQ64253 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ly6eQ64253 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ly6eQ64253 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ly6eQ64253 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ly6eQ64253 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ly6eQ64253 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ly6eQ64253 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ly6eQ64253 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ly6eQ64253 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ly6eQ64253 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ly6eQ64253 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ly6eQ64253 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ly6eQ64253 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ly6eQ64253 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ly6eQ64253 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ly6eQ64253 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ly6eQ64253 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ly6eQ64253 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ly6eQ64253 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ly6eQ64253 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ly6eQ64253 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ly6eQ64253 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ly6eQ64253 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ly6eQ64253 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ly6eQ64253 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ly6eQ64253 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ly6eQ64253 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ly6eQ64253 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ly6eQ64253 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ly6eQ64253 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ly6eQ64253 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ly6eQ64253 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ly6eQ64253 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ly6eQ64253 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ly6eQ64253 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ly6eQ64253 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ly6eQ64253 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ly6eQ64253 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ly6eQ64253 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ly6eQ64253 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ly6eQ64253 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ly6eQ64253 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ly6eQ64253 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ly6eQ64253 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ly6eQ64253 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ly6eQ64253 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ly6eQ64253 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ly6eQ64253 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ly6eQ64253 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ly6eQ64253 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms