Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ccdc18Q640L5 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ccdc18Q640L5 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ccdc18Q640L5 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ccdc18Q640L5 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ccdc18Q640L5 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ccdc18Q640L5 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ccdc18Q640L5 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ccdc18Q640L5 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ccdc18Q640L5 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ccdc18Q640L5 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ccdc18Q640L5 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ccdc18Q640L5 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ccdc18Q640L5 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ccdc18Q640L5 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Ccdc18Q640L5 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ccdc18Q640L5 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ccdc18Q640L5 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Ccdc18Q640L5 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ccdc18Q640L5 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ccdc18Q640L5 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ccdc18Q640L5 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ccdc18Q640L5 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ccdc18Q640L5 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ccdc18Q640L5 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ccdc18Q640L5 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ccdc18Q640L5 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ccdc18Q640L5 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ccdc18Q640L5 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Ccdc18Q640L5 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ccdc18Q640L5 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ccdc18Q640L5 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ccdc18Q640L5 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ccdc18Q640L5 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ccdc18Q640L5 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ccdc18Q640L5 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ccdc18Q640L5 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ccdc18Q640L5 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ccdc18Q640L5 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ccdc18Q640L5 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ccdc18Q640L5 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ccdc18Q640L5 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ccdc18Q640L5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ccdc18Q640L5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ccdc18Q640L5 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ccdc18Q640L5 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ccdc18Q640L5 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ccdc18Q640L5 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ccdc18Q640L5 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ccdc18Q640L5 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ccdc18Q640L5 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Ccdc18Q640L5 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Ccdc18Q640L5 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ccdc18Q640L5 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ccdc18Q640L5 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ccdc18Q640L5 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ccdc18Q640L5 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ccdc18Q640L5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ccdc18Q640L5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ccdc18Q640L5 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ccdc18Q640L5 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ccdc18Q640L5 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ccdc18Q640L5 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ccdc18Q640L5 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ccdc18Q640L5 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ccdc18Q640L5 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ccdc18Q640L5 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ccdc18Q640L5 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ccdc18Q640L5 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ccdc18Q640L5 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ccdc18Q640L5 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ccdc18Q640L5 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ccdc18Q640L5 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ccdc18Q640L5 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Ccdc18Q640L5 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ccdc18Q640L5 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ccdc18Q640L5 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ccdc18Q640L5 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ccdc18Q640L5 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ccdc18Q640L5 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ccdc18Q640L5 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ccdc18Q640L5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ccdc18Q640L5 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ccdc18Q640L5 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ccdc18Q640L5 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ccdc18Q640L5 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ccdc18Q640L5 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ccdc18Q640L5 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ccdc18Q640L5 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ccdc18Q640L5 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ccdc18Q640L5 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ccdc18Q640L5 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ccdc18Q640L5 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ccdc18Q640L5 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ccdc18Q640L5 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ccdc18Q640L5 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Ccdc18Q640L5 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ccdc18Q640L5 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ccdc18Q640L5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ccdc18Q640L5 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
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