Protein–RNA interactions for Protein: Q64008

Rab34, Ras-related protein Rab-34, mousemouse

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab34Q64008 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab34Q64008 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab34Q64008 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab34Q64008 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab34Q64008 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab34Q64008 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab34Q64008 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab34Q64008 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab34Q64008 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab34Q64008 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab34Q64008 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab34Q64008 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab34Q64008 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab34Q64008 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab34Q64008 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab34Q64008 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rab34Q64008 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rab34Q64008 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rab34Q64008 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rab34Q64008 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rab34Q64008 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rab34Q64008 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rab34Q64008 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rab34Q64008 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rab34Q64008 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rab34Q64008 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rab34Q64008 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rab34Q64008 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rab34Q64008 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rab34Q64008 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rab34Q64008 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rab34Q64008 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rab34Q64008 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab34Q64008 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab34Q64008 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab34Q64008 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab34Q64008 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab34Q64008 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab34Q64008 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab34Q64008 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab34Q64008 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab34Q64008 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab34Q64008 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab34Q64008 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab34Q64008 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab34Q64008 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab34Q64008 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab34Q64008 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab34Q64008 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab34Q64008 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab34Q64008 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab34Q64008 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab34Q64008 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab34Q64008 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab34Q64008 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab34Q64008 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab34Q64008 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab34Q64008 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab34Q64008 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab34Q64008 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab34Q64008 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab34Q64008 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab34Q64008 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab34Q64008 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab34Q64008 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab34Q64008 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab34Q64008 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab34Q64008 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab34Q64008 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab34Q64008 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab34Q64008 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab34Q64008 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab34Q64008 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab34Q64008 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab34Q64008 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab34Q64008 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab34Q64008 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab34Q64008 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab34Q64008 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab34Q64008 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab34Q64008 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab34Q64008 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab34Q64008 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab34Q64008 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab34Q64008 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab34Q64008 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab34Q64008 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab34Q64008 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab34Q64008 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab34Q64008 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab34Q64008 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab34Q64008 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab34Q64008 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab34Q64008 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab34Q64008 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab34Q64008 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab34Q64008 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab34Q64008 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab34Q64008 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab34Q64008 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms