Protein–RNA interactions for Protein: Q62520

Zic2, Zinc finger protein ZIC 2, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic2Q62520 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zic2Q62520 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zic2Q62520 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zic2Q62520 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zic2Q62520 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zic2Q62520 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zic2Q62520 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zic2Q62520 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zic2Q62520 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zic2Q62520 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zic2Q62520 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zic2Q62520 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zic2Q62520 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zic2Q62520 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zic2Q62520 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zic2Q62520 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zic2Q62520 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zic2Q62520 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zic2Q62520 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zic2Q62520 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zic2Q62520 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zic2Q62520 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zic2Q62520 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Zic2Q62520 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zic2Q62520 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zic2Q62520 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Zic2Q62520 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zic2Q62520 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zic2Q62520 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zic2Q62520 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zic2Q62520 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zic2Q62520 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zic2Q62520 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zic2Q62520 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zic2Q62520 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zic2Q62520 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zic2Q62520 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zic2Q62520 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zic2Q62520 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zic2Q62520 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Zic2Q62520 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zic2Q62520 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zic2Q62520 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zic2Q62520 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zic2Q62520 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zic2Q62520 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zic2Q62520 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zic2Q62520 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zic2Q62520 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Zic2Q62520 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Zic2Q62520 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zic2Q62520 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zic2Q62520 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zic2Q62520 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zic2Q62520 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zic2Q62520 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zic2Q62520 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zic2Q62520 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Zic2Q62520 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zic2Q62520 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zic2Q62520 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zic2Q62520 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zic2Q62520 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zic2Q62520 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zic2Q62520 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Zic2Q62520 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zic2Q62520 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zic2Q62520 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Zic2Q62520 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zic2Q62520 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zic2Q62520 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zic2Q62520 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zic2Q62520 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zic2Q62520 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zic2Q62520 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zic2Q62520 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zic2Q62520 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zic2Q62520 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zic2Q62520 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zic2Q62520 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zic2Q62520 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zic2Q62520 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zic2Q62520 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zic2Q62520 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zic2Q62520 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zic2Q62520 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zic2Q62520 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zic2Q62520 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zic2Q62520 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zic2Q62520 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zic2Q62520 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zic2Q62520 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zic2Q62520 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zic2Q62520 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zic2Q62520 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zic2Q62520 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zic2Q62520 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Zic2Q62520 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zic2Q62520 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zic2Q62520 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms