Protein–RNA interactions for Protein: Q62445

Sp4, Transcription factor Sp4, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp4Q62445 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sp4Q62445 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sp4Q62445 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sp4Q62445 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sp4Q62445 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Sp4Q62445 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Sp4Q62445 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sp4Q62445 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sp4Q62445 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sp4Q62445 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sp4Q62445 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sp4Q62445 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Sp4Q62445 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sp4Q62445 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sp4Q62445 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sp4Q62445 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Sp4Q62445 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sp4Q62445 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sp4Q62445 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sp4Q62445 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sp4Q62445 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sp4Q62445 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sp4Q62445 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sp4Q62445 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sp4Q62445 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sp4Q62445 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sp4Q62445 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sp4Q62445 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sp4Q62445 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sp4Q62445 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sp4Q62445 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sp4Q62445 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sp4Q62445 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sp4Q62445 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Sp4Q62445 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sp4Q62445 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sp4Q62445 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sp4Q62445 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sp4Q62445 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sp4Q62445 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sp4Q62445 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sp4Q62445 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sp4Q62445 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sp4Q62445 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sp4Q62445 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sp4Q62445 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sp4Q62445 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sp4Q62445 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sp4Q62445 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sp4Q62445 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sp4Q62445 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Sp4Q62445 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sp4Q62445 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sp4Q62445 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sp4Q62445 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sp4Q62445 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sp4Q62445 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sp4Q62445 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sp4Q62445 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sp4Q62445 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sp4Q62445 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sp4Q62445 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sp4Q62445 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sp4Q62445 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sp4Q62445 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sp4Q62445 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sp4Q62445 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sp4Q62445 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sp4Q62445 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sp4Q62445 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sp4Q62445 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sp4Q62445 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sp4Q62445 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sp4Q62445 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sp4Q62445 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sp4Q62445 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sp4Q62445 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sp4Q62445 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sp4Q62445 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sp4Q62445 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sp4Q62445 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Sp4Q62445 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sp4Q62445 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sp4Q62445 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sp4Q62445 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sp4Q62445 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sp4Q62445 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sp4Q62445 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sp4Q62445 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sp4Q62445 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sp4Q62445 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sp4Q62445 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sp4Q62445 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sp4Q62445 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sp4Q62445 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sp4Q62445 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sp4Q62445 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sp4Q62445 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sp4Q62445 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sp4Q62445 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms