Protein–RNA interactions for Protein: Q62312

Tgfbr2, TGF-beta receptor type-2, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfbr2Q62312 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Tgfbr2Q62312 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tgfbr2Q62312 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms