Protein–RNA interactions for Protein: Q62277

Syp, Synaptophysin, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SypQ62277 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SypQ62277 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SypQ62277 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SypQ62277 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SypQ62277 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SypQ62277 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SypQ62277 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SypQ62277 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SypQ62277 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SypQ62277 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SypQ62277 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SypQ62277 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SypQ62277 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SypQ62277 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SypQ62277 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SypQ62277 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SypQ62277 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SypQ62277 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SypQ62277 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SypQ62277 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SypQ62277 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SypQ62277 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SypQ62277 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SypQ62277 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SypQ62277 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SypQ62277 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SypQ62277 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SypQ62277 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SypQ62277 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SypQ62277 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SypQ62277 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SypQ62277 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SypQ62277 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SypQ62277 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SypQ62277 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SypQ62277 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SypQ62277 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SypQ62277 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SypQ62277 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SypQ62277 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SypQ62277 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SypQ62277 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SypQ62277 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SypQ62277 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SypQ62277 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SypQ62277 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SypQ62277 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SypQ62277 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SypQ62277 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SypQ62277 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SypQ62277 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SypQ62277 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SypQ62277 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SypQ62277 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SypQ62277 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SypQ62277 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SypQ62277 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SypQ62277 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SypQ62277 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SypQ62277 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SypQ62277 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SypQ62277 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SypQ62277 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SypQ62277 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SypQ62277 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SypQ62277 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SypQ62277 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SypQ62277 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SypQ62277 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SypQ62277 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SypQ62277 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SypQ62277 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SypQ62277 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SypQ62277 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SypQ62277 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SypQ62277 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SypQ62277 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SypQ62277 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SypQ62277 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SypQ62277 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SypQ62277 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SypQ62277 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SypQ62277 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SypQ62277 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SypQ62277 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SypQ62277 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SypQ62277 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SypQ62277 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SypQ62277 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SypQ62277 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SypQ62277 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SypQ62277 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SypQ62277 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SypQ62277 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SypQ62277 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SypQ62277 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SypQ62277 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SypQ62277 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SypQ62277 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SypQ62277 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.2 ms