Protein–RNA interactions for Protein: Q62147

Sspn, Sarcospan, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SspnQ62147 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SspnQ62147 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SspnQ62147 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SspnQ62147 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SspnQ62147 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SspnQ62147 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SspnQ62147 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SspnQ62147 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SspnQ62147 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SspnQ62147 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SspnQ62147 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SspnQ62147 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SspnQ62147 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SspnQ62147 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SspnQ62147 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SspnQ62147 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SspnQ62147 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SspnQ62147 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SspnQ62147 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SspnQ62147 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SspnQ62147 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SspnQ62147 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SspnQ62147 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SspnQ62147 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SspnQ62147 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SspnQ62147 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SspnQ62147 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SspnQ62147 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SspnQ62147 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SspnQ62147 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SspnQ62147 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SspnQ62147 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SspnQ62147 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SspnQ62147 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SspnQ62147 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SspnQ62147 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SspnQ62147 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SspnQ62147 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SspnQ62147 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SspnQ62147 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SspnQ62147 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
SspnQ62147 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SspnQ62147 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SspnQ62147 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SspnQ62147 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SspnQ62147 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SspnQ62147 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SspnQ62147 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SspnQ62147 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SspnQ62147 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SspnQ62147 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SspnQ62147 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SspnQ62147 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SspnQ62147 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SspnQ62147 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SspnQ62147 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SspnQ62147 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SspnQ62147 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SspnQ62147 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SspnQ62147 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SspnQ62147 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SspnQ62147 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SspnQ62147 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SspnQ62147 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SspnQ62147 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SspnQ62147 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SspnQ62147 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SspnQ62147 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SspnQ62147 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SspnQ62147 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SspnQ62147 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SspnQ62147 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SspnQ62147 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SspnQ62147 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SspnQ62147 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SspnQ62147 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SspnQ62147 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SspnQ62147 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SspnQ62147 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SspnQ62147 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SspnQ62147 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SspnQ62147 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SspnQ62147 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SspnQ62147 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SspnQ62147 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SspnQ62147 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SspnQ62147 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SspnQ62147 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SspnQ62147 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SspnQ62147 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SspnQ62147 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SspnQ62147 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SspnQ62147 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SspnQ62147 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SspnQ62147 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SspnQ62147 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SspnQ62147 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SspnQ62147 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SspnQ62147 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SspnQ62147 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms