Protein–RNA interactions for Protein: Q62066

Phox2a, Paired mesoderm homeobox protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2aQ62066 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Phox2aQ62066 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms