Protein–RNA interactions for Protein: Q61999

Odf1, Outer dense fiber protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf1Q61999 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Odf1Q61999 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Odf1Q61999 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Odf1Q61999 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Odf1Q61999 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Odf1Q61999 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Odf1Q61999 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Odf1Q61999 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Odf1Q61999 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Odf1Q61999 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Odf1Q61999 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Odf1Q61999 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Odf1Q61999 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Odf1Q61999 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Odf1Q61999 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Odf1Q61999 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Odf1Q61999 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Odf1Q61999 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Odf1Q61999 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Odf1Q61999 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Odf1Q61999 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Odf1Q61999 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Odf1Q61999 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Odf1Q61999 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Odf1Q61999 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Odf1Q61999 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Odf1Q61999 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Odf1Q61999 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Odf1Q61999 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Odf1Q61999 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Odf1Q61999 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Odf1Q61999 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Odf1Q61999 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Odf1Q61999 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Odf1Q61999 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Odf1Q61999 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Odf1Q61999 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Odf1Q61999 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Odf1Q61999 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Odf1Q61999 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Odf1Q61999 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Odf1Q61999 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Odf1Q61999 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Odf1Q61999 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Odf1Q61999 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Odf1Q61999 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Odf1Q61999 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Odf1Q61999 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Odf1Q61999 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Odf1Q61999 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Odf1Q61999 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Odf1Q61999 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Odf1Q61999 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Odf1Q61999 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Odf1Q61999 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Odf1Q61999 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Odf1Q61999 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Odf1Q61999 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Odf1Q61999 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Odf1Q61999 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Odf1Q61999 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Odf1Q61999 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Odf1Q61999 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Odf1Q61999 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Odf1Q61999 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Odf1Q61999 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Odf1Q61999 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Odf1Q61999 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Odf1Q61999 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Odf1Q61999 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Odf1Q61999 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Odf1Q61999 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Odf1Q61999 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Odf1Q61999 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Odf1Q61999 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Odf1Q61999 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Odf1Q61999 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Odf1Q61999 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Odf1Q61999 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Odf1Q61999 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Odf1Q61999 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Odf1Q61999 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Odf1Q61999 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Odf1Q61999 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Odf1Q61999 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Odf1Q61999 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Odf1Q61999 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Odf1Q61999 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Odf1Q61999 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Odf1Q61999 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Odf1Q61999 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Odf1Q61999 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Odf1Q61999 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Odf1Q61999 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Odf1Q61999 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Odf1Q61999 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Odf1Q61999 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Odf1Q61999 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Odf1Q61999 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Odf1Q61999 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms