Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Itga6Q61739 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Itga6Q61739 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Itga6Q61739 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Itga6Q61739 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Itga6Q61739 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Itga6Q61739 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Itga6Q61739 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Itga6Q61739 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Itga6Q61739 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Itga6Q61739 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Itga6Q61739 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Itga6Q61739 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Itga6Q61739 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Itga6Q61739 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Itga6Q61739 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Itga6Q61739 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Itga6Q61739 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Itga6Q61739 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Itga6Q61739 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Itga6Q61739 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Itga6Q61739 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Itga6Q61739 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Itga6Q61739 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Itga6Q61739 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Itga6Q61739 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itga6Q61739 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itga6Q61739 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Itga6Q61739 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itga6Q61739 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itga6Q61739 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itga6Q61739 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Itga6Q61739 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itga6Q61739 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Itga6Q61739 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itga6Q61739 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itga6Q61739 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itga6Q61739 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itga6Q61739 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itga6Q61739 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itga6Q61739 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itga6Q61739 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itga6Q61739 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Itga6Q61739 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Itga6Q61739 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Itga6Q61739 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Itga6Q61739 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Itga6Q61739 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Itga6Q61739 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Itga6Q61739 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Itga6Q61739 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Itga6Q61739 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Itga6Q61739 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Itga6Q61739 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Itga6Q61739 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Itga6Q61739 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Itga6Q61739 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Itga6Q61739 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Itga6Q61739 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Itga6Q61739 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Itga6Q61739 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Itga6Q61739 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Itga6Q61739 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Itga6Q61739 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Itga6Q61739 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Itga6Q61739 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Itga6Q61739 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Itga6Q61739 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Itga6Q61739 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Itga6Q61739 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Itga6Q61739 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Itga6Q61739 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Itga6Q61739 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Itga6Q61739 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Itga6Q61739 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Itga6Q61739 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Itga6Q61739 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Itga6Q61739 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Itga6Q61739 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Itga6Q61739 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Itga6Q61739 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Itga6Q61739 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Itga6Q61739 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Itga6Q61739 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Itga6Q61739 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Itga6Q61739 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Itga6Q61739 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Itga6Q61739 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Itga6Q61739 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Itga6Q61739 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Itga6Q61739 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Itga6Q61739 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Itga6Q61739 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Itga6Q61739 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
Itga6Q61739 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Itga6Q61739 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Itga6Q61739 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Itga6Q61739 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Itga6Q61739 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Itga6Q61739 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms