Protein–RNA interactions for Protein: Q61474

Msi1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi1Q61474 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Msi1Q61474 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Msi1Q61474 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Msi1Q61474 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Msi1Q61474 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Msi1Q61474 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Msi1Q61474 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Msi1Q61474 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Msi1Q61474 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Msi1Q61474 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Msi1Q61474 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Msi1Q61474 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Msi1Q61474 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Msi1Q61474 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Msi1Q61474 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Msi1Q61474 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Msi1Q61474 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Msi1Q61474 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Msi1Q61474 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Msi1Q61474 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Msi1Q61474 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Msi1Q61474 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Msi1Q61474 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Msi1Q61474 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Msi1Q61474 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Msi1Q61474 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Msi1Q61474 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Msi1Q61474 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Msi1Q61474 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Msi1Q61474 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Msi1Q61474 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Msi1Q61474 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Msi1Q61474 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Msi1Q61474 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Msi1Q61474 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Msi1Q61474 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Msi1Q61474 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Msi1Q61474 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Msi1Q61474 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Msi1Q61474 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Msi1Q61474 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Msi1Q61474 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Msi1Q61474 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Msi1Q61474 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Msi1Q61474 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Msi1Q61474 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Msi1Q61474 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Msi1Q61474 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Msi1Q61474 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Msi1Q61474 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Msi1Q61474 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Msi1Q61474 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Msi1Q61474 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Msi1Q61474 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Msi1Q61474 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Msi1Q61474 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Msi1Q61474 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Msi1Q61474 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Msi1Q61474 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Msi1Q61474 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Msi1Q61474 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Msi1Q61474 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Msi1Q61474 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Msi1Q61474 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Msi1Q61474 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Msi1Q61474 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Msi1Q61474 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Msi1Q61474 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Msi1Q61474 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Msi1Q61474 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Msi1Q61474 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Msi1Q61474 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Msi1Q61474 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Msi1Q61474 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Msi1Q61474 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Msi1Q61474 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Msi1Q61474 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Msi1Q61474 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Msi1Q61474 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Msi1Q61474 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Msi1Q61474 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Msi1Q61474 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Msi1Q61474 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Msi1Q61474 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Msi1Q61474 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Msi1Q61474 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Msi1Q61474 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Msi1Q61474 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Msi1Q61474 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Msi1Q61474 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Msi1Q61474 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Msi1Q61474 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Msi1Q61474 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Msi1Q61474 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Msi1Q61474 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Msi1Q61474 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Msi1Q61474 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Msi1Q61474 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Msi1Q61474 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Msi1Q61474 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms