Protein–RNA interactions for Protein: Q61451

Cd53, Leukocyte surface antigen CD53, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd53Q61451 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd53Q61451 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd53Q61451 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd53Q61451 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd53Q61451 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd53Q61451 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd53Q61451 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd53Q61451 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd53Q61451 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd53Q61451 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd53Q61451 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd53Q61451 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd53Q61451 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd53Q61451 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd53Q61451 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd53Q61451 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd53Q61451 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd53Q61451 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd53Q61451 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd53Q61451 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd53Q61451 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd53Q61451 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd53Q61451 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd53Q61451 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd53Q61451 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd53Q61451 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd53Q61451 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd53Q61451 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd53Q61451 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd53Q61451 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd53Q61451 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd53Q61451 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd53Q61451 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd53Q61451 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd53Q61451 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd53Q61451 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd53Q61451 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd53Q61451 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd53Q61451 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd53Q61451 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Cd53Q61451 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd53Q61451 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd53Q61451 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd53Q61451 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd53Q61451 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd53Q61451 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd53Q61451 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd53Q61451 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd53Q61451 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd53Q61451 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd53Q61451 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd53Q61451 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd53Q61451 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd53Q61451 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd53Q61451 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd53Q61451 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd53Q61451 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd53Q61451 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd53Q61451 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd53Q61451 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd53Q61451 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd53Q61451 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd53Q61451 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd53Q61451 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd53Q61451 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd53Q61451 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd53Q61451 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd53Q61451 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd53Q61451 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd53Q61451 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd53Q61451 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd53Q61451 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd53Q61451 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd53Q61451 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd53Q61451 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd53Q61451 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd53Q61451 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd53Q61451 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd53Q61451 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd53Q61451 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd53Q61451 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd53Q61451 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd53Q61451 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd53Q61451 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd53Q61451 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd53Q61451 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd53Q61451 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd53Q61451 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd53Q61451 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd53Q61451 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd53Q61451 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd53Q61451 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd53Q61451 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd53Q61451 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd53Q61451 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd53Q61451 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd53Q61451 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd53Q61451 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd53Q61451 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd53Q61451 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms