Protein–RNA interactions for Protein: Q61271

Acvr1b, Activin receptor type-1B, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acvr1bQ61271 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Acvr1bQ61271 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Acvr1bQ61271 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Acvr1bQ61271 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Acvr1bQ61271 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Acvr1bQ61271 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Acvr1bQ61271 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Acvr1bQ61271 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Acvr1bQ61271 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Acvr1bQ61271 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Acvr1bQ61271 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Acvr1bQ61271 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Acvr1bQ61271 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Acvr1bQ61271 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Acvr1bQ61271 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Acvr1bQ61271 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Acvr1bQ61271 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Acvr1bQ61271 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Acvr1bQ61271 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Acvr1bQ61271 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Acvr1bQ61271 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Acvr1bQ61271 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Acvr1bQ61271 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Acvr1bQ61271 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Acvr1bQ61271 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Acvr1bQ61271 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Acvr1bQ61271 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Acvr1bQ61271 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Acvr1bQ61271 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Acvr1bQ61271 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Acvr1bQ61271 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Acvr1bQ61271 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Acvr1bQ61271 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Acvr1bQ61271 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Acvr1bQ61271 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Acvr1bQ61271 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Acvr1bQ61271 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Acvr1bQ61271 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Acvr1bQ61271 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Acvr1bQ61271 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Acvr1bQ61271 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Acvr1bQ61271 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Acvr1bQ61271 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Acvr1bQ61271 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Acvr1bQ61271 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Acvr1bQ61271 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Acvr1bQ61271 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Acvr1bQ61271 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Acvr1bQ61271 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Acvr1bQ61271 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Acvr1bQ61271 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Acvr1bQ61271 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Acvr1bQ61271 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Acvr1bQ61271 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Acvr1bQ61271 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Acvr1bQ61271 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Acvr1bQ61271 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Acvr1bQ61271 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Acvr1bQ61271 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Acvr1bQ61271 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Acvr1bQ61271 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Acvr1bQ61271 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Acvr1bQ61271 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Acvr1bQ61271 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Acvr1bQ61271 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Acvr1bQ61271 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Acvr1bQ61271 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Acvr1bQ61271 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Acvr1bQ61271 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Acvr1bQ61271 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Acvr1bQ61271 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Acvr1bQ61271 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Acvr1bQ61271 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Acvr1bQ61271 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Acvr1bQ61271 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Acvr1bQ61271 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Acvr1bQ61271 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Acvr1bQ61271 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Acvr1bQ61271 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Acvr1bQ61271 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Acvr1bQ61271 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Acvr1bQ61271 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Acvr1bQ61271 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Acvr1bQ61271 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Acvr1bQ61271 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Acvr1bQ61271 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Acvr1bQ61271 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Acvr1bQ61271 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Acvr1bQ61271 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Acvr1bQ61271 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Acvr1bQ61271 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Acvr1bQ61271 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Acvr1bQ61271 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Acvr1bQ61271 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Acvr1bQ61271 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Acvr1bQ61271 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Acvr1bQ61271 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Acvr1bQ61271 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Acvr1bQ61271 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Acvr1bQ61271 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms