Protein–RNA interactions for Protein: Q61241

Tssk1b, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tssk1bQ61241 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tssk1bQ61241 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tssk1bQ61241 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tssk1bQ61241 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tssk1bQ61241 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tssk1bQ61241 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tssk1bQ61241 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tssk1bQ61241 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tssk1bQ61241 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tssk1bQ61241 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tssk1bQ61241 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tssk1bQ61241 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tssk1bQ61241 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tssk1bQ61241 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tssk1bQ61241 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tssk1bQ61241 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tssk1bQ61241 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tssk1bQ61241 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tssk1bQ61241 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tssk1bQ61241 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tssk1bQ61241 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tssk1bQ61241 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tssk1bQ61241 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tssk1bQ61241 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tssk1bQ61241 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tssk1bQ61241 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tssk1bQ61241 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tssk1bQ61241 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tssk1bQ61241 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tssk1bQ61241 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tssk1bQ61241 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tssk1bQ61241 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tssk1bQ61241 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tssk1bQ61241 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tssk1bQ61241 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tssk1bQ61241 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tssk1bQ61241 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tssk1bQ61241 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tssk1bQ61241 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tssk1bQ61241 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tssk1bQ61241 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tssk1bQ61241 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tssk1bQ61241 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tssk1bQ61241 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tssk1bQ61241 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tssk1bQ61241 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tssk1bQ61241 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tssk1bQ61241 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tssk1bQ61241 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tssk1bQ61241 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tssk1bQ61241 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tssk1bQ61241 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tssk1bQ61241 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tssk1bQ61241 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tssk1bQ61241 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tssk1bQ61241 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tssk1bQ61241 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tssk1bQ61241 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tssk1bQ61241 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tssk1bQ61241 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tssk1bQ61241 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tssk1bQ61241 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tssk1bQ61241 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tssk1bQ61241 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tssk1bQ61241 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tssk1bQ61241 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tssk1bQ61241 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tssk1bQ61241 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tssk1bQ61241 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tssk1bQ61241 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tssk1bQ61241 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tssk1bQ61241 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tssk1bQ61241 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tssk1bQ61241 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tssk1bQ61241 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tssk1bQ61241 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tssk1bQ61241 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tssk1bQ61241 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tssk1bQ61241 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tssk1bQ61241 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tssk1bQ61241 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tssk1bQ61241 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tssk1bQ61241 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tssk1bQ61241 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tssk1bQ61241 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tssk1bQ61241 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tssk1bQ61241 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tssk1bQ61241 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tssk1bQ61241 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tssk1bQ61241 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tssk1bQ61241 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tssk1bQ61241 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tssk1bQ61241 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tssk1bQ61241 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tssk1bQ61241 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tssk1bQ61241 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tssk1bQ61241 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tssk1bQ61241 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tssk1bQ61241 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tssk1bQ61241 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms