Protein–RNA interactions for Protein: Q61009

Scarb1, Scavenger receptor class B member 1, mousemouse

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb1Q61009 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Scarb1Q61009 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Scarb1Q61009 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Scarb1Q61009 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Scarb1Q61009 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Scarb1Q61009 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Scarb1Q61009 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Scarb1Q61009 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Scarb1Q61009 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Scarb1Q61009 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Scarb1Q61009 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Scarb1Q61009 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Scarb1Q61009 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Scarb1Q61009 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Scarb1Q61009 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Scarb1Q61009 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Scarb1Q61009 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Scarb1Q61009 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Scarb1Q61009 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Scarb1Q61009 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Scarb1Q61009 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Scarb1Q61009 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Scarb1Q61009 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Scarb1Q61009 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Scarb1Q61009 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Scarb1Q61009 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Scarb1Q61009 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Scarb1Q61009 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Scarb1Q61009 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Scarb1Q61009 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Scarb1Q61009 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Scarb1Q61009 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Scarb1Q61009 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Scarb1Q61009 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Scarb1Q61009 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Scarb1Q61009 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Scarb1Q61009 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Scarb1Q61009 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Scarb1Q61009 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Scarb1Q61009 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Scarb1Q61009 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Scarb1Q61009 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Scarb1Q61009 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Scarb1Q61009 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Scarb1Q61009 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Scarb1Q61009 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Scarb1Q61009 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Scarb1Q61009 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Scarb1Q61009 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Scarb1Q61009 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Scarb1Q61009 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Scarb1Q61009 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Scarb1Q61009 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Scarb1Q61009 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Scarb1Q61009 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Scarb1Q61009 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Scarb1Q61009 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Scarb1Q61009 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Scarb1Q61009 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Scarb1Q61009 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Scarb1Q61009 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Scarb1Q61009 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scarb1Q61009 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scarb1Q61009 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scarb1Q61009 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scarb1Q61009 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scarb1Q61009 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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