Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
JrkQ60976 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
JrkQ60976 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
JrkQ60976 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
JrkQ60976 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
JrkQ60976 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
JrkQ60976 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
JrkQ60976 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
JrkQ60976 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
JrkQ60976 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
JrkQ60976 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
JrkQ60976 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
JrkQ60976 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
JrkQ60976 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
JrkQ60976 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
JrkQ60976 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
JrkQ60976 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
JrkQ60976 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
JrkQ60976 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
JrkQ60976 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
JrkQ60976 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
JrkQ60976 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
JrkQ60976 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
JrkQ60976 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
JrkQ60976 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
JrkQ60976 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
JrkQ60976 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
JrkQ60976 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
JrkQ60976 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
JrkQ60976 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
JrkQ60976 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
JrkQ60976 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
JrkQ60976 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
JrkQ60976 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
JrkQ60976 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
JrkQ60976 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
JrkQ60976 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
JrkQ60976 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
JrkQ60976 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
JrkQ60976 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
JrkQ60976 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
JrkQ60976 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
JrkQ60976 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
JrkQ60976 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
JrkQ60976 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
JrkQ60976 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
JrkQ60976 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
JrkQ60976 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
JrkQ60976 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
JrkQ60976 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
JrkQ60976 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
JrkQ60976 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
JrkQ60976 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
JrkQ60976 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
JrkQ60976 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
JrkQ60976 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
JrkQ60976 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
JrkQ60976 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
JrkQ60976 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
JrkQ60976 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
JrkQ60976 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
JrkQ60976 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
JrkQ60976 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
JrkQ60976 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
JrkQ60976 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
JrkQ60976 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
JrkQ60976 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
JrkQ60976 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
JrkQ60976 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
JrkQ60976 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
JrkQ60976 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
JrkQ60976 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
JrkQ60976 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
JrkQ60976 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
JrkQ60976 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
JrkQ60976 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
JrkQ60976 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
JrkQ60976 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
JrkQ60976 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
JrkQ60976 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
JrkQ60976 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
JrkQ60976 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
JrkQ60976 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
JrkQ60976 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
JrkQ60976 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
JrkQ60976 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
JrkQ60976 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
JrkQ60976 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
JrkQ60976 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
JrkQ60976 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
JrkQ60976 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
JrkQ60976 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
JrkQ60976 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
JrkQ60976 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
JrkQ60976 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
JrkQ60976 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
JrkQ60976 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
JrkQ60976 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
JrkQ60976 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
JrkQ60976 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms