Protein–RNA interactions for Protein: Q60954

Meis1, Homeobox protein Meis1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Meis1Q60954 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Meis1Q60954 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Meis1Q60954 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Meis1Q60954 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Meis1Q60954 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Meis1Q60954 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Meis1Q60954 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Meis1Q60954 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Meis1Q60954 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Meis1Q60954 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Meis1Q60954 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Meis1Q60954 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Meis1Q60954 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Meis1Q60954 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Meis1Q60954 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Meis1Q60954 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Meis1Q60954 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Meis1Q60954 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Meis1Q60954 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Meis1Q60954 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Meis1Q60954 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Meis1Q60954 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Meis1Q60954 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Meis1Q60954 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Meis1Q60954 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Meis1Q60954 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Meis1Q60954 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Meis1Q60954 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Meis1Q60954 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Meis1Q60954 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Meis1Q60954 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Meis1Q60954 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Meis1Q60954 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Meis1Q60954 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Meis1Q60954 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Meis1Q60954 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Meis1Q60954 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Meis1Q60954 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Meis1Q60954 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Meis1Q60954 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Meis1Q60954 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Meis1Q60954 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Meis1Q60954 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Meis1Q60954 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Meis1Q60954 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Meis1Q60954 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Meis1Q60954 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Meis1Q60954 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Meis1Q60954 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Meis1Q60954 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Meis1Q60954 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Meis1Q60954 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Meis1Q60954 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Meis1Q60954 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Meis1Q60954 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Meis1Q60954 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Meis1Q60954 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Meis1Q60954 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Meis1Q60954 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Meis1Q60954 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Meis1Q60954 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Meis1Q60954 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Meis1Q60954 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Meis1Q60954 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Meis1Q60954 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Meis1Q60954 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Meis1Q60954 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Meis1Q60954 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Meis1Q60954 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Meis1Q60954 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Meis1Q60954 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Meis1Q60954 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Meis1Q60954 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Meis1Q60954 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Meis1Q60954 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Meis1Q60954 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Meis1Q60954 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Meis1Q60954 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Meis1Q60954 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Meis1Q60954 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Meis1Q60954 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Meis1Q60954 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Meis1Q60954 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Meis1Q60954 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Meis1Q60954 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Meis1Q60954 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Meis1Q60954 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Meis1Q60954 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Meis1Q60954 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Meis1Q60954 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Meis1Q60954 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Meis1Q60954 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Meis1Q60954 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Meis1Q60954 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Meis1Q60954 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Meis1Q60954 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Meis1Q60954 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Meis1Q60954 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Meis1Q60954 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Meis1Q60954 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms