Protein–RNA interactions for Protein: Q60925

Dbp, D site-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DbpQ60925 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DbpQ60925 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DbpQ60925 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DbpQ60925 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DbpQ60925 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DbpQ60925 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DbpQ60925 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DbpQ60925 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DbpQ60925 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DbpQ60925 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DbpQ60925 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DbpQ60925 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DbpQ60925 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DbpQ60925 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DbpQ60925 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DbpQ60925 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DbpQ60925 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DbpQ60925 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DbpQ60925 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DbpQ60925 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DbpQ60925 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DbpQ60925 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DbpQ60925 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DbpQ60925 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DbpQ60925 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DbpQ60925 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DbpQ60925 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DbpQ60925 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DbpQ60925 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DbpQ60925 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DbpQ60925 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DbpQ60925 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DbpQ60925 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DbpQ60925 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DbpQ60925 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DbpQ60925 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DbpQ60925 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DbpQ60925 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DbpQ60925 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DbpQ60925 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DbpQ60925 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DbpQ60925 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DbpQ60925 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DbpQ60925 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DbpQ60925 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DbpQ60925 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DbpQ60925 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DbpQ60925 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DbpQ60925 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DbpQ60925 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DbpQ60925 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DbpQ60925 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DbpQ60925 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DbpQ60925 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DbpQ60925 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DbpQ60925 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DbpQ60925 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DbpQ60925 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DbpQ60925 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DbpQ60925 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DbpQ60925 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DbpQ60925 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DbpQ60925 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DbpQ60925 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DbpQ60925 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DbpQ60925 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DbpQ60925 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DbpQ60925 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DbpQ60925 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DbpQ60925 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DbpQ60925 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DbpQ60925 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DbpQ60925 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DbpQ60925 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
DbpQ60925 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DbpQ60925 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DbpQ60925 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DbpQ60925 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DbpQ60925 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
DbpQ60925 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DbpQ60925 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DbpQ60925 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DbpQ60925 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DbpQ60925 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DbpQ60925 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DbpQ60925 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DbpQ60925 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DbpQ60925 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DbpQ60925 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DbpQ60925 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DbpQ60925 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DbpQ60925 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DbpQ60925 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DbpQ60925 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DbpQ60925 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
DbpQ60925 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DbpQ60925 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DbpQ60925 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DbpQ60925 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
DbpQ60925 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms