Protein–RNA interactions for Protein: Q60846

Tnfrsf8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf8Q60846 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfrsf8Q60846 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfrsf8Q60846 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfrsf8Q60846 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfrsf8Q60846 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfrsf8Q60846 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfrsf8Q60846 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfrsf8Q60846 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfrsf8Q60846 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfrsf8Q60846 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfrsf8Q60846 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfrsf8Q60846 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfrsf8Q60846 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfrsf8Q60846 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfrsf8Q60846 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfrsf8Q60846 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfrsf8Q60846 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfrsf8Q60846 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfrsf8Q60846 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfrsf8Q60846 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfrsf8Q60846 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfrsf8Q60846 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfrsf8Q60846 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfrsf8Q60846 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfrsf8Q60846 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfrsf8Q60846 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfrsf8Q60846 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfrsf8Q60846 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfrsf8Q60846 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfrsf8Q60846 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfrsf8Q60846 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfrsf8Q60846 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfrsf8Q60846 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfrsf8Q60846 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfrsf8Q60846 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfrsf8Q60846 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfrsf8Q60846 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfrsf8Q60846 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfrsf8Q60846 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfrsf8Q60846 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfrsf8Q60846 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfrsf8Q60846 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfrsf8Q60846 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfrsf8Q60846 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfrsf8Q60846 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfrsf8Q60846 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfrsf8Q60846 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfrsf8Q60846 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfrsf8Q60846 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfrsf8Q60846 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfrsf8Q60846 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfrsf8Q60846 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfrsf8Q60846 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfrsf8Q60846 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfrsf8Q60846 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfrsf8Q60846 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfrsf8Q60846 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfrsf8Q60846 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfrsf8Q60846 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfrsf8Q60846 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfrsf8Q60846 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfrsf8Q60846 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfrsf8Q60846 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfrsf8Q60846 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfrsf8Q60846 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfrsf8Q60846 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfrsf8Q60846 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfrsf8Q60846 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfrsf8Q60846 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfrsf8Q60846 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfrsf8Q60846 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfrsf8Q60846 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfrsf8Q60846 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfrsf8Q60846 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfrsf8Q60846 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfrsf8Q60846 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfrsf8Q60846 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfrsf8Q60846 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfrsf8Q60846 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfrsf8Q60846 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfrsf8Q60846 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfrsf8Q60846 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfrsf8Q60846 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfrsf8Q60846 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfrsf8Q60846 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfrsf8Q60846 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfrsf8Q60846 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfrsf8Q60846 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfrsf8Q60846 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfrsf8Q60846 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfrsf8Q60846 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfrsf8Q60846 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfrsf8Q60846 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfrsf8Q60846 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfrsf8Q60846 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfrsf8Q60846 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfrsf8Q60846 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfrsf8Q60846 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfrsf8Q60846 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfrsf8Q60846 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms